玉米矮花叶病是世界上发生普遍、危害严重的病毒病害，也是我国重要的玉米病害。挖掘优异抗源并开展抗病遗传研究是进行抗病育种的基础。国内外以成株鉴定为基础，在玉米第三和第六染色体的着丝点附近发现了两个抗玉米矮花叶病基因簇。利用四一开展基因簇研究的优点在于已明确抗病基因的其它材料只有一个抗病基因或QTLs，而课题组筛选出的优异抗源四一中的两个抗病主基因分布于两个抗病基因簇上，而且初步发现抗病过程中抗病基因的作用方式不同，因而是进行基因簇研究的优异材料。利用分子育种选育出抗病NIL是研究的关键环节。课题组用抗病基因紧密连锁的双侧分子标记进行前景选择；在亲本间筛选出的135对微卫星标记用于背景选择，通过一次杂交、三次回交和一次自交，即可获得具有感病自交系Mo17背景的3个抗病NILs，通过抗病NIL结合F2分析，探索抗病过程中两个抗病基因的作用方式，为深入研究两个抗病基因簇奠定基础。