tRNA 5' 末端加工酶PRORP1催化机理的研究

批准号:
31100579
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
谢伟
依托单位:
学科分类:
C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
秦湘静、邹寰、李雪、游支任
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中文摘要
转运RNA(tRNA)把活化的氨基酸转移到核糖体内进行蛋白翻译,是基因表达的关键一步。具有生理活性的tRNA对细胞极其重要,而tRNA合成过程的紊乱则与多种疾病的发生密切相关。前体tRNA在成熟过程中必须经过5'端前导序列的剪切,此过程通常由核糖核酸酶RNase P 中的核酶 P RNA部分完成。但在拟南芥叶绿体、线粒体及众多高等真核生物的细胞器中, 前体tRNA 5'端序列的剪切功能完全由蛋白酶PRORP1取代,并不具有RNA 部分。本课题针对拟南芥PRORP1 的结构与生化性质进行研究,在获得其晶体结构后,与其它核酸酶结构进行比较,试图了解PRORP1这一在真核生物中高度保守酶的起源和进化。在阐述PRORP1催化机理的分子机制的同时,对其生理意义作出调查。
英文摘要
所有生物体tRNA首先都是以前体tRNA (Precursor tRNA, 简称pre-tRNA)的形式被RNA聚合酶III转录出来,经一系列加工,成为成熟的,具有生理活性的tRNA分子。Pre-tRNA的剪切由数种tRNA核酸内切酶来完成,其中RNase P则是催化剪切pre-tRNA前导序列的重要酶类。PRORP (ProteinaceousRNase P)家族蛋白是在拟南芥(Arabidopsis)中发现的唯一具有RNase P样活性的蛋白质,并且其构成中不含有核酶组分[1]。PROPR 家族包括PRORP1、PRORP2和PRORP3三个成员。PRORP2和PRORP3主要存在于细胞核中,PRORP1存在于叶绿体和线粒体中[2]。由于PROPR蛋白酶独立加工tRNA 5’端的成熟方式极为独特,研究其催化机理具有较高的理论价值。本课题以解析PRORP1的晶体结构为目标,从分子水平上研究PRORP1,了解其底物识别与化学催化机制,并调查tRNA 5’端的成熟酶的进化起源。在项目研究过程中,我们系统地探究了PRORP1蛋白各结构域的特性及其行使的功能。为获得其晶体结构,我们进行了大量的克隆、表达及结晶工作;并且利用体外活性实验的方法,充分研究并揭示了PRORP1蛋白的各片段对于底物pre-tRNA分子的识别及催化的特性, 发现了该酶对底物的广谱性。此外,我们对PRORP1同家族的蛋白PRORP2和PRORP3的表征及结晶尝试。虽然我们并未率先获得PRORP1 纯蛋白的结构及其与pre-tRNA分子的复合物结构, 我们获得了一些用于结晶的生物大分子(或片段)的晶体,这些前期结果对这些分子今后的结构研究,提供了研究基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Structure of human endonuclease V as an inosine-specific ribonuclease
人核酸内切酶 V 作为肌苷特异性核糖核酸酶的结构
DOI:--
发表时间:2014
期刊:Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography
影响因子:--
作者:Zhang, Zhemin;Hao, Zhitai;Wang, Zhong;Li, Qing;Xie, Wei
通讯作者:Xie, Wei
Cocrystal Structures of Glycyl-tRNA Synthetase in Complex with tRNA Suggest Multiple Conformational States in Glycylation
甘氨酰-tRNA 合成酶与 tRNA 复合物的共晶结构表明甘氨酰化存在多种构象状态
DOI:10.1074/jbc.m114.557249
发表时间:2014-07-18
期刊:JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:4.8
作者:Qin, Xiangjing;Hao, Zhitai;Xie, Wei
通讯作者:Xie, Wei
双金属离子酶YerA催化6mA脱氨的分子机制及其在表观遗传学上的影响
- 批准号:n/a
- 项目类别:省市级项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2022
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
新型毒素-抗毒素家族GNAT/RHH的翻译后修饰的催化路径、调控机制及生理意义的研究
- 批准号:--
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:54万元
- 批准年份:2022
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
深海奇古菌在黑暗食物链中作用的研究
- 批准号:92051117
- 项目类别:重大研究计划
- 资助金额:80.0万元
- 批准年份:2020
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
拟南芥鸟苷脱氨酶 GSDA 的结构与功能研究
- 批准号:2020A1515010966
- 项目类别:省市级项目
- 资助金额:10.0万元
- 批准年份:2020
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
结核分枝杆菌毒素-抗毒素家族MazEF-mt9参与耐药机制调控的研究
- 批准号:31870782
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:59.0万元
- 批准年份:2018
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
长江口及毗邻东海区域异养古菌MGII对溶解有机碳利用类型的探究
- 批准号:41776137
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:66.0万元
- 批准年份:2017
- 负责人:谢伟
- 依托单位:
国内基金
海外基金
