山东银莲花分布于海拔600米以上中国山东省的昆嵛山和崂山以及日本四国岛的石槌山，是山东省稀有物种，有两种典型的生境：湿润的针阔混交林下和干燥的山顶灌丛。首先对不同居群的分布格局、细胞学、繁育系统进行了研究，结果表明生境对其存在不同程度的影响。为揭示山东银莲花的遗传多样性及生境的影响，采用蛋白质组学的方法对四个居群进行了研究，同时通过AFLP分子标记做了DNA水平上多样性研究。结果表明：二者都表现出相对较高的遗传多样性，据此推测自然状态下山东银莲花的适应能力较强；诸多生态因子中，光和海拔是主要的影响因素。故提出如下保护建议：由于受海拔影响明显，应以就地保护为主；受生境影响较大，应严格保护生境免遭破坏；遗传多样性指数较高，而且多来自居群内，应保护每一个居群。本研究为山东银莲花的合理开发提供一定的理论依据和科学指导，同时蛋白质组学的应用为植物保护生物学研究提供一条新的思路。