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蓝藻和红藻藻胆体中连接蛋白进化的生物信息学和比较蛋白质组学研究

批准号：
40676078
项目类别：
面上项目
资助金额：
35.0 万元
负责人：
张玉忠
依托单位：
山东大学
学科分类：
生物海洋学与海洋生物资源
结题年份：
2009
批准年份：
2006
项目状态：
已结题
项目参与者：
孙彩云、刘鲁宁、解彬彬、苏海楠、邵思蜜、张起
关键词：
进化蛋白质组学生物信息学连接蛋白藻胆体

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项目成果

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中文摘要
藻胆体是蓝藻和红藻光合作用的捕光复合物，是由带色素的藻胆蛋白和大多数无色的连接蛋白自组装而成的有序超分子复合物。本研究首先从公共数据库中搜集各种连接蛋白和藻胆蛋白的一维序列和三维晶体结构信息，运用生物信息学技术，开展连接蛋白的分子进化的研究以及连接蛋白与藻胆蛋白共进化研究，在国内外首次提出连接蛋白的进化模式和连接蛋白与藻胆蛋白共进化模式。在此基础上，以不同藻胆蛋白组成和不同结构类型的典型蓝藻和红藻为材料，应用蛋白质组学研究技术，开展不同藻胆体中连接蛋白的比较蛋白质组学的研究，为阐明藻胆体连接蛋白的进化提供实验证据。最终，结合分子进化和比较蛋白质组学的研究结果，构建连接蛋白的进化模型，阐明进化过程中超分子体系内分子间相互作用协同进化的规律，为最终阐明藻胆体超分子复合物的自组装机制以及高效吸能和传能的机制提供理论依据。
英文摘要
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Predicting Intra- and Inter-protein Interaction Interfaces from Protein Sequences: Case Studies of Subtilisin and Phycocyanin
从蛋白质序列预测蛋白质内和蛋白质间相互作用界面：枯草杆菌蛋白酶和藻蓝蛋白的案例研究
DOI： --
发表时间： --
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作者： [张玉忠]
通讯作者： 张玉忠
Probing the pH sensitivity of R-phycoerythrin: Investigations of active conformational and functional variation
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Watching the Native Supramolecular Architecture of Photosynthetic Membrane in Red Algae TOPOGRAPHY OF PHYCOBILISOMES AND THEIR CROWDING, DIVERSE DISTRIBUTION PATTERNS
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通讯作者： Zhang, Yu-Zhong
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发表时间： --
期刊： PLoS ONE
影响因子： 3.7
作者： [张玉忠]
通讯作者： 张玉忠
海洋微生物驱动有机硫DMSP循环的新类群、新机制与代谢调控
  • 批准号：
    32330001
  • 项目类别：
    重点项目
  • 资助金额：
    229万元
  • 批准年份：
    2023
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
海洋细菌驱动重要有机氮氧化三甲胺（TMAO）生物地球化学循环的生化过程与分子机制
  • 批准号：
    91851205
  • 项目类别：
    重大研究计划
  • 资助金额：
    280.0万元
  • 批准年份：
    2018
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
深海细菌参与D-氨基酸再循环利用的生命过程、机制及相关酶资源应用潜力评价
  • 批准号：
    U1706207
  • 项目类别：
    联合基金项目
  • 资助金额：
    282.0万元
  • 批准年份：
    2017
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
玫瑰杆菌(Roseobacter)参与海洋表层有机硫DMSP循环的机制及生理生态学适应的生物化学基础
  • 批准号：
    31630012
  • 项目类别：
    重点项目
  • 资助金额：
    269.0万元
  • 批准年份：
    2016
  • 负责人：
    张玉忠
  • 依托单位：
    山东大学
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