全新骨架组蛋白甲基转移酶G9a抑制剂的构效关系、结合模式及作用机制研究
批准号:
81502915
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
17.9 万元
负责人:
郭小可
依托单位:
学科分类:
合成药物化学
结题年份:
2018
批准年份:
2015
项目状态:
已结题
项目参与者:
张晓进、傅蓉、冯涛涛、陈维琳、林宏智、张晴
中文摘要
组蛋白赖氨酸甲基转移酶G9a与肿瘤的发生发展密切相关,被认为是具有广阔前景的抗肿瘤靶标而在近年来受到广泛关注。本项目针对目前G9a小分子抑制剂的结构类型少、缺乏蛋白空腔结合模式、无体内药效学数据等问题,利用化学信息学及生物信息学手段构建形状相似形模型,发现并获得具有G9a抑制活性的全新骨架结构苗头化合物FTT-8。本项目通过分析FTT-8结构与G9a蛋白的结合模式,指导苗头化合物的结构改造及优化并进行构效关系探索,利用药物化学方法研究G9a蛋白的空腔信息以及与小分子底物之间的结合位点及结合模式,发现并获得结构新颖、活性明确的高亲和力小分子抑制剂,并以此为分子探针揭示G9a与小分子底物识别的关键药效特征,同时对活性较好的小分子进行生物机制学研究以探究G9a在肿瘤治疗领域的相关生物学信息,为后续小分子抑制剂的研究提供理论依据及参考。
英文摘要
Histone lysine methyltransferase G9a is considered as an anti-cancer target for its tight correlated with tumor. In order to extend the structure type of G9a inhibitor and study the binding mode between G9a protein and small molecule, ROCS model was built in our group and hit compound with moderate inhibitory activity was discovered. In this project, we will design, synthesize and bio-evaluate the molecules based on the structure of hit, then structure-activity relationship will be discussed. This project will clarify the binding mode and binding site of G9a protein with small molecule substrate and provide a reference for the next study of G9a inhibitors. Some new skeleton G9a inhibitors that deserved for further evaluation will also be obtained in this project.
组蛋白赖氨酸甲基转移酶G9a与肿瘤的发生发展密切相关,被认为是具有广阔前景的抗肿瘤靶标而在近年来受到广泛关注。本项目针对目前G9a小分子抑制剂的结构类型少、缺乏蛋白空腔结合模式、无体内药效学数据等问题,利用化学信息学及生物信息学手段构建形状相似形模型,发现并获得具有G9a抑制活性的全新骨架结构苗头化合物。.本项目通过分析苗头化合物结构与G9a蛋白的结合模式,进行结构改造及优化,合成小分子抑制剂55个,并对全部目标化合物进行酶水平和细胞水平活性评价,大部分化合物显示出了较好的靶标活性,进而对部分化合物进行了成药性中的理化性质进行了初步评价。综合评价结果,选取具有较好开发前景的化合物进行药代动力学性质等测试,得到候选化合物1个。通过本项目的开展得到了较为全面的构效关系,并讨论了G9a与化合物之间的结合模式,为后续G9a的研究以及小分子抑制剂的再设计提供理论依据及参考。与此同时,在组蛋白甲基转移酶G9a研究的同时,我们对组蛋白去甲基化酶JMJD2A进行了初步研究,对组蛋白甲基转移酶G9a和组蛋白去甲基化酶JMJD2A同时研究可以观察两种不同功能的酶对同一疾病的影响,故具有较大意义,此研究部分对三种不同的Fe(II)螯合基团进行探索性研究。获得40余个化合物,对目标化合物进行酶水平和细胞水平活性评价,并对部分化合物进行了初步成药性评价,此部分工作得到了在JMJD2A和PHD2之间具有选择性的化合物。这些工作均为相关领域的后续研究奠定基础。.本项目共发表SCI论文7篇,申请中国发明专利3项,其中授权专利一项。培养2名博士生研究生,4名硕士研究生。
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Novel 5-carboxy-8-HQ based histone demethylase JMJD2A inhibitors: Introduction of an additional carboxyl group at the C-2 position of quinoline
基于 5-羧基-8-HQ 的新型组蛋白去甲基酶 JMJD2A 抑制剂:在喹啉的 C-2 位引入额外的羧基
DOI:
10.1016/j.ejmech.2015.09.013
发表时间:
2015-11-13
期刊:
EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:
6.7
作者:
[Feng, Taotao, Li, Dongdong, Guo, Xiaoke]
通讯作者:
Guo, Xiaoke
Design, synthesis, and initial evaluation of affinity-based small molecular probe for detection of WDR5
用于检测 WDR5 的基于亲和力的小分子探针的设计、合成和初步评估
DOI:
10.1016/j.bioorg.2017.11.018
发表时间:
2018-02-01
期刊:
BIOORGANIC CHEMISTRY
影响因子:
5.1
作者:
[Chen, Wei-Lin, Li, Dong-Dong, You, Qi-Dong]
通讯作者:
You, Qi-Dong
High-affinity small molecular blockers of mixed lineage leukemia 1 (MLL1)-WDR5 interaction inhibit MLL1 complex H3K4 methyltransferase activity
混合谱系白血病 1 (MLL1)-WDR5 相互作用的高亲和力小分子阻断剂抑制 MLL1 复合物 H3K4 甲基转移酶活性
DOI:
10.1016/j.ejmech.2016.08.036
发表时间:
2016-11-29
期刊:
EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:
6.7
作者:
[Li, Dong-Dong, Chen, Wei-Lin, Guo, Xiao-Ke]
通讯作者:
Guo, Xiao-Ke
Targeting protein-protein interaction between MLL1 and reciprocal proteins for leukemia therapy
靶向 MLL1 和互补蛋白之间的蛋白质-蛋白质相互作用用于白血病治疗
DOI:
10.1016/j.bmc.2017.11.045
发表时间:
2017
期刊:
Bioorganic & Medicinal Chemistry
影响因子:
3.5
作者:
[Zhihui Wang, Dongdong Li, Weilin Chen, Qidong You, Xiaoke Guo]
通讯作者:
Xiaoke Guo
Discovery, design and synthesis of 6H-anthra[1,9-cd]isoxazol-6-one scaffold as G9a inhibitor through a combination of shape-based virtual screening and structure-based molecular modification
通过基于形状的虚拟筛选和基于结构的分子修饰相结合,发现、设计和合成作为 G9a 抑制剂的 6H-anthra[1,9-cd]isoxazol-6-one 支架
DOI:
10.1016/j.bmc.2016.09.071
发表时间:
2016-11-15
期刊:
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:
3.5
作者:
[Chen, Wei-Lin, Wang, Zhi-Hui, Guo, Xiao-Ke]
通讯作者:
Guo, Xiao-Ke
共 9 条
基于KH3/4假二聚体虎钳构象发现、设计m6A阅读蛋白IGF2BP2的变构抑制剂并探索其在急性白血病中的应用
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批准号:82473789
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2024
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负责人:郭小可
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依托单位:
基于靶标结构设计、合成高选择性ALKBH5抑制剂并探索其在肿瘤疾病中的应用
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:55万元
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批准年份:2021
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负责人:郭小可
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依托单位:
通过构象调控方法设计MLL1-WDR5蛋白-蛋白相互作用小分子抑制剂并探索其在血液肿瘤中的应用
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批准号:81872799
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2018
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负责人:郭小可
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依托单位:
国内基金
海外基金