土生空团菌[Cenococcum geophilum Fr.]是一种重要的外生菌根真菌，具有突出的抗旱性。其地理分布和宿主范围都非常广泛。目前，国内关于土生空团菌遗传多样的研究还很少，因此，本文对35个中国菌株和4个法国菌株的rDNA ITS区域和18S、28S rDNA中I型内含子进行测序，结合GenBank的相关数据，分析其核苷酸序列差异和RNA二级结构特征，进一步研究影响土生空团菌遗传分化的因素。主要结果如下： .1、34个中国土生空团菌有22个菌株在18S rDNA中有I型内含子。序列分析表明18S rDNA中的I型内含子序列长度为488bp~590bp。其5’端序列比较保守，3’端序列有差异。二级结构显示I型内含子有10个配对区（P1~P10），P5区域由P5，P5a，P5b，P5c，P5d组成，P9的3’端有2个配对区（P9.1、P9.2）。系统发育分析表明每个地区的土生空团菌有一定的遗传多样性；其中遗传多样性和地理区域有很大的关系，和寄主没有明显相关性。.2、34个中国土生空团菌有21个菌株在28S rDNA中有I型内含子。28S rDNA中的I型内含子序列长度为570bp~607bp。其5’端序列有差异，3’端序列比较保守。二级结构显示28S rDNA中的I型内含子有10个配对区（P1~P10），P1区域由P1，P1a，P1b组成，P5区域由P5，P5a，P5b，P5c组成。由于没有土生空团菌28S rDNA中内含子序列的报道，无法进行全面的系统发育分析。.3、土生空团菌rDNA ITS区序列长度为422bp~447bp，显示出93.8%~100%的同源性。其中ITS1和ITS2区均可形成稳定的RNA二级结构，表明它们在rRNA转录后加工中发挥着作用。系统发育分析表明每个地区的土生空团菌都有一定的遗传多样性；其中聚在一起的菌株基本来源于相同地理区域，而菌株的亲缘关系与寄主没有明显相关性。