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WDR82介导Setd1A复合物定位于基因转录起始位点进而调控基因转录的分子机理研究

批准号:
31300629
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
刘珂
依托单位:
学科分类:
分子生物物理
结题年份:
2016
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘艳丽、郑雅、张巍、邓小杰、舒晓

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项目成果

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中文摘要
WDR82蛋白作为Setd1A/B复合物中重要的调控蛋白在胚胎发育过程中发挥重要作用,其缺失将会导致胚胎发育延迟和胚胎死亡等现象。最新研究表明,WDR82蛋白通过同时识别结合SETD1A蛋白的N端和RNA聚合酶Ⅱ的磷酸化C端结构域介导Setd1A复合物定位于目的基因的转录起始位点,从而调控基因转录。但WDR82介导这一过程的分子结合机理还不清楚。本项目拟在上述研究基础上,解析WDR82-SETD1A-RNA聚合酶Ⅱ的磷酸化C端结构域的复合体结构,并结合多种分子生物学、生物物理学手段,从分子水平揭示WDR82同时结合SETD1A蛋白的N端和RNA聚合酶Ⅱ的磷酸化C端结构域介导Setd1A复合物定位于目的基因转录起始位点的分子机理,阐明WDR82蛋白在Setd1A复合物调控基因转录过程中的重要作用;本项目的顺利实施,将为后续的药物开发提供分子结构和理论基础。
英文摘要
WDR82, as an important regulatory component of Setd1A/B methyltransferase complexes, plays a crucial role in normal early embryonic development. A defect in WDR82 leads to stunted embryonic development and death. Recently, it was demonstrated that WDR82 interacts with the N terminal of SETD1A and additionally binds to the phosphorylated C-terminal domain of RNA polymerase II, which can recruit the Setd1A methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed genes. However, the molecular mechanism of WDR82 how to recruit the Setd1A methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed genes is still elusive. Hence, this project plans to get the ternary complex structure of WDR82, SETD1A and phosphorylated C-terminal domain of RNA polymerase II, coupled with molecular biological and biophysical experiments to elaborate the molecular mechanism of WDR82 recruiting Setd1A methyltransferase complex to the transcription start sites through interacting with the N terminal of SETD1A and phosphorylated C-terminal domain of RNA polymerase II. Furthermore, we will illustrate the functional significance of WDR82 involved in regulating of Setd1A complex at transcriptionally active genes. Finally, the information derived from these studies will lay an important foundation for further drug discovery.
WDR82作为Setd1A复合物的重要调控蛋白在胚胎发育过程中发挥重要作用,其缺失将导致胚胎发育延迟和死亡等现象。前期研究表明,WDR82通过同时识别结合SETD1A和RNA聚合酶Ⅱ存在于此复合物中,并因此相互作用而介导Setd1A复合物定位于目的基因转录起始位点,但WDR82介导这一过程的分子结合机理还未知。.我们系统研究了WDR82识别SETD1A及RNA聚合酶Ⅱ的不同磷酸化修饰CTD多肽的特异性。通过不同晶体生长条件、蛋白酶处理、单克隆FAB筛选、氨基酸定点突变等方法对WDR82识别SETD1A和RNA聚合酶Ⅱ的复合物晶体进行了筛选及研究。为了解析WDR82晶体结构,我们鉴定并获得了WDR82识别PP1RA的复合物并进行了晶体筛选。此外,我们进行了AP-MS质谱实验,分析了WDR82新的潜在结合蛋白。.ITC和Pull down 结果表明,WDR82分别结合 SETD1A aa.60-90片段和PP1RA aa.451-510片段及Ser5-P CTD多肽。WDR82结合Ser5-P CTD受到Ser2-P和Ser7-P磷酸化修饰的影响。Ser2-P阻碍WDR82与Ser5-P位点的结合,但Ser7-P对WDR82结合Ser5-P的影响不明显。此外,SETD1A 能够增强双磷酸化Ser5/7-P CTD多肽与WDR82的结合。通过噬菌体展示技术,我们获得了WDR82的特异识别FAB,并组装了WDR82-FAB复合物,进行了复合物晶体筛选。AP-MS实验不仅检测到了目前已被报道的WDR82相关复合物,如Setd1A/B和PTW/PP1等,同时还鉴定了WDR82新的潜在识别蛋白,例如ZC3H4蛋白及端粒蛋白复合体组分TERF2蛋白等。上述数据为进一步研究WDR82介导Setd1A复合物的生物学功能及拓展WDR82的新生物学功能认识提供了重要的研究基础。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: --
发表时间: 2016
期刊: Current Protein & Peptide Science
影响因子:
作者: [Liu, Yanli, Yang, Jihong, Liu, Jinlin, Qi, Chao, ]
通讯作者:
Determination of Human Ral Guanine Nucleotide Dissociation Stimulator Ras Binding Domain by X-ray Diffraction
X射线衍射法测定人Ral鸟嘌呤核苷酸解离刺激剂Ras结合域
DOI: --
发表时间: 2015
期刊: Chinese Journal of Analytical Chemistry
影响因子: 1.2
作者: [Liu Yan-Li, Liu Ke, Zhao Hao-Bin, Qi Chao]
通讯作者: Qi Chao
Determination of glutathione in apoptotic SMMC-7221 cells induced by xylitol selenite using capillary electrophoresis
毛细管电泳法测定木糖醇亚硒酸盐诱导的 SMMC-7221 细胞凋亡中谷胱甘肽的含量
DOI: 10.1007/s10529-016-2056-9
发表时间: 2016-02
期刊: Biotechnology Letters
影响因子: 2.7
作者: [Yang, Jihong, Xiong, Guomei, Yao, Hanchao, Qi, Chao]
通讯作者: Qi, Chao
核因子I家族基因突变导致神经发育障碍的分子机制
  • 批准号:
    32571447
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50.00万元
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    刘珂
  • 依托单位:
人源PGC-1α-NRF1-TFAM途径调控线粒体生物发生的分子机制
  • 批准号:
    32371328
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    刘珂
  • 依托单位:
MIS复合物介导酵母孢子形成的分子机制研究
  • 批准号:
    31770834
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    刘珂
  • 依托单位:
国内基金
海外基金