课题基金 / 基金详情

基于"一致推举法"的细胞核DNA单倍型统计推断的研究

批准号：
30870360
项目类别：
面上项目
资助金额：
33.0 万元
负责人：
张德兴
依托单位：
中国科学院动物研究所
学科分类：
环境与生物演化
结题年份：
2011
批准年份：
2008
项目状态：
已结题
项目参与者：
陈新、陈佳、张静
关键词：
单倍型推断细胞核DNA标记谱系分子生态学

项目摘要

结项摘要

项目成果

张德兴的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
细胞核DNA的单倍型推测问题是学术界公认的现阶段分子生态学和进化研究领域的技术难题，严重制约了该类标记的有效使用。最近我们所建立的单倍型推断的一致推举法（consensus vote approach）解决了其中一个核心问题，即各种统计算法所推测出的结果的可靠性问题。本项目拟对其它相关问题进行深入研究，通过溯祖模拟，系统研究一些主要种群遗传参数对一致推举法的影响，摸清影响细胞核DNA单倍型推测错误的主要因素，以及推测错误对于分子生态学研究结果的影响，在此基础上探索能在一定程度上避免复杂的统计推断过程而又不影响后续分析的准确性的单倍型推断方法。有关结果可望对于使用scnpDNA标记在分子生态学和进化研究中的应用具有普遍指导意义。本项目还将编写和测试完善一个旨在使一致推举法这一研究策略和分析过程自动化的软件包，以方便研究人员进行分析。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Internal algorithm variability and among‐algorithm discordance in statistical haplotype reconstruction
统计单倍型重建中的内部算法变异性和算法间不一致
DOI： 10.1111/j.1365-294x.2009.04147.x
发表时间： 2009
期刊： Molecular Ecology
影响因子： 4.9
作者： [Zushi Huang, Ya‐Jie Ji, De]
通讯作者： De
CVhaplot: a consensus tool for statistical haplotyping
DOI： 10.1111/j.1755-0998.2010.02843.x
发表时间： 2010-11
期刊： Molecular Ecology Resources
影响因子： 7.7
作者： [Zushi Huang;De-Xing Zhang]
通讯作者： Zushi Huang;De-Xing Zhang
Measuring population differentiation using GST or D? A simulation study with microsatellite DNA markers under a finite island model and nonequilibrium conditions
DOI： 10.1111/j.1365-294x.2011.05108.x
发表时间： 2011-06-01
期刊： MOLECULAR ECOLOGY
影响因子： 4.9
作者： [Leng, Liang, Zhang, De-Xing]
通讯作者： Zhang, De-Xing
东亚钳蝎细胞核DNA突变速率的测定
  • 批准号：
    31672271
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    65.0万元
  • 批准年份：
    2016
  • 负责人：
    张德兴
  • 依托单位：
    中国科学院动物研究所
吕梁山隆起时间的谱系生物地理学研究
  • 批准号：
    41471047
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    95.0万元
  • 批准年份：
    2014
  • 负责人：
    张德兴
  • 依托单位：
    中国科学院动物研究所
种内谱系进化关系分析中的可靠性自举检验问题
  • 批准号：
    30970429
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万元
  • 批准年份：
    2009
  • 负责人：
    张德兴
  • 依托单位：
    中国科学院动物研究所
几种代表性动物区域性演化模式的谱系生物地理学比较研究
  • 批准号：
    30730016
  • 项目类别：
    重点项目
  • 资助金额：
    160.0万元
  • 批准年份：
    2007
  • 负责人：
    张德兴
  • 依托单位：
    中国科学院动物研究所
国内基金
海外基金