细胞核DNA的单倍型推测问题是学术界公认的现阶段分子生态学和进化研究领域的技术难题，严重制约了该类标记的有效使用。最近我们所建立的单倍型推断的一致推举法（consensus vote approach）解决了其中一个核心问题，即各种统计算法所推测出的结果的可靠性问题。本项目拟对其它相关问题进行深入研究，通过溯祖模拟，系统研究一些主要种群遗传参数对一致推举法的影响，摸清影响细胞核DNA单倍型推测错误的主要因素，以及推测错误对于分子生态学研究结果的影响，在此基础上探索能在一定程度上避免复杂的统计推断过程而又不影响后续分析的准确性的单倍型推断方法。有关结果可望对于使用scnpDNA标记在分子生态学和进化研究中的应用具有普遍指导意义。本项目还将编写和测试完善一个旨在使一致推举法这一研究策略和分析过程自动化的软件包，以方便研究人员进行分析。