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LINC01312调控TCF21表达在川崎病冠状动脉损伤中的分子机制研究

批准号:
82070513
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
刘芳
依托单位:
学科分类:
循环系统感染和免疫相关疾病
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘芳

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
川崎病冠状动脉病变(CAL)是决定患儿远期预后的重要因素,病因与发病机制不明。课题组通过全基因组关联研究发现,非编码RNA基因LINC01312 rs1208285多态性与川崎病CAL发生相关。表达数量性状基因座分析提示该位点可调控转录因子21(TCF21)表达。文献报道TCF21可调控TNF-α和IL-6等炎症因子的释放,因此推测LINC01312调控TCF21表达参与川崎病CAL的发生。本课题拟:在另一组独立人群中验证该位点与CAL的相关性;在人单核细胞和人冠状动脉内皮细胞共培养模型中,研究LINC01312多态性调控TCF21表达对内皮功能的影响,并通过ChIP-seq和RNA-seq确定其调控的下游信号通路和炎症因子;CRISPR/Cas9构建点突变小鼠,观察小鼠炎症反应和冠状动脉病变。本课题有助于从lncRNA角度理解川崎病CAL发生机制,为临床早期预测和治疗CAL提供理论依据。
英文摘要
Coronary artery lesion (CAL) caused by Kawasaki disease is an important factor in determining children’s long-term prognosis. The etiology and pathogenesis remain unclear. Through a genome-wide association study, we found that the non-coding RNA gene LINC01312 rs1208285 polymorphism was associated with CAL in Kawasaki disease patients. Expression quantitative trait loci analysis indicats that rs1208285 can regulate the expression of transcription factor 21 (TCF21), which is reported to have an association with the release of inflammatory factors such as TNF-α and IL-6. We speculate that LINC01312 regulates TCF21 expression and therefore plays a role in the occurrence of CAL. In this study, we intend to verify the association between LINC01312 rs1208285 and CAL in an independent group of patients with Kawasaki disease; investigate the regulatory mechanism of LINC01312 polymorphism on TCF21 expression and on endothelial function in co-cultured human monocytes and human coronary endothelial cells; determine the downstream signaling pathways and inflammatory factors regulated by TCF21 through ChIP-seq and RNA-seq; construct point-mutant mice by CRISPR/Cas9 and study the effects of rs1208285 on inflammation and coronary arteries. This study helps to understand the mechanism of CAL in Kawasaki disease from a perspective of lncRNA, and provides theoretical basis for its early predictation and managment of CAL.
川崎病(KD)是一种儿童系统性血管炎,冠状动脉病变(CAL)是影响患儿远期预后的关键因素。然而,KD的病因及发病机制尚不明确。本研究基于前期全基因组关联分析(GWAS)发现的LINC01312 rs1208285多态性,进一步探讨其与CAL的相关性及潜在分子机制。本项目预期研究内容包括:1 通过临床样本确认LINC01312 rs1208285 位点多态性与川崎病CAL相关性。2 通过体内实验,分析LINC01312多态性对炎症因子与冠脉内皮细胞的影响,及调控TCF21及下游信号通路的分子机制。3 构建LINC01312多态性小鼠,分析不同基因型小鼠对KD模型中炎症水平和冠脉病变情况。我们在扩大的1329例KD患儿(360例CAL和969例NCAL)中对LINC01312多态性与CAL的相关性进行验证,结果显示等位基因频率在CAL组和非CAL组中不存在显著差异。体内实验发现,LINC01312促进THP1细胞炎症水平,并抑制共培养的冠脉内皮细胞的增殖情况,这种变化不受多态性的影响。由于LINC01312多态性与CAL的相关性未得到充分证实,课题组拟基于转录组测序探索KD相关的lncRNA及其潜在机制。对KD患儿与发热对照患儿的外周血白细胞进行lncRNA测序,共鉴定581个差异表达lncRNA,并在扩大样本中验证LINC01355 可作为KD诊断的潜在生物标志物,构建了lncRNA相关的KD诊断模型。进一步功能实验显示,LINC01355过表达可加剧KD细胞模型的氧化应激,表现为活性氧水平升高,超氧化物歧化酶水平降低。此外,LINC01355可与具有抗氧化功能的SERPINB3蛋白相互作用,并通过Wnt、PI3K-Akt等氧化应激相关信号通路介导KD的发生发展。综上,本研究结合临床样本、多组学分析及体内实验,系统探讨了lncRNA在KD中的作用机制。研究结果不仅为KD的早期诊断提供了新的生物标志物,还揭示了LINC01355通过氧化应激途径介导KD发生,为KD个性化治疗提供了潜在靶点和理论依据。
Tbx20调控心脏瓣膜生长发育的信号通路研究
  • 批准号:
    81670282
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    刘芳
  • 依托单位:
转录因子COUP-TFI/II对大脑皮质和嗅球中间神经元发生发育的调控作用及细胞和分子机制
  • 批准号:
    31371098
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    15.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    刘芳
  • 依托单位:
前列腺癌进展和去势抵抗个体差异的遗传研究
  • 批准号:
    81202001
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2012
  • 负责人:
    刘芳
  • 依托单位:
局灶性脑缺血后海马内的神经发生及其在学习记忆中的作用
  • 批准号:
    30900425
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万元
  • 批准年份:
    2009
  • 负责人:
    刘芳
  • 依托单位:
国内基金
海外基金