拟南芥中受十字花科黑腐病菌(Xcc)诱导(或抑制)的非编码RNA的鉴定

批准号:
31071141
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
唐纪良
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
李祥江、张华、黄明慧、梅雄
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中文摘要
非编码RNA,也叫小RNA,是一类分子较小,通常不编码蛋白,但具有独立功能的RNA分子。非编码RNA广泛存在于各种物种中,并且在细胞的各种生理过程中发挥重要作用。最近的研究发现,一些拟南芥非编码RNA的表达受丁香假单胞菌侵染的特异诱导,并且在对抗丁香假单胞菌侵染的防卫反应中起重要作用。本申请课题的目的是,先利用Solexa测序技术,分别(平行)鉴定被十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc)侵染和没有Xcc侵染的拟南芥中表达的非编码RNA,然后通过统计和Northern杂交定量分析,比较在这两种条件下各非编码RNA的表达量,确定受Xcc诱导(或抑制)的非编码RNA,为研究非编码RNA在对抗Xcc侵染的防卫反应中的作用以及更全面地了解寄主植物与Xcc相互作用的分子机理奠定基础。
英文摘要
非编码RNA,也叫小RNA,是一类分子较小,通常不编码蛋白,但具有独立功能的RNA分子。非编码RNA广泛存在于各种物种中,并且在细胞的各种生理过程中发挥重要作用。最近的研究发现,一些拟南芥非编码RNA (miRNAs/siRNAs) 的表达受丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)侵染的特异诱导,并且在对抗丁香假单胞菌侵染的防卫反应中起重要作用。为了揭示拟南芥非编码RNA在对抗十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc)侵染的防卫反应中的作用,本研究利用Solexa RNA测序技术(RNA-Seq),分别鉴定了被Xcc野生型菌株和III型分泌途径缺陷突变体ΔhrcV侵染以及没有被Xcc侵染的拟南芥叶片中表达的非编码RNA,通过比较在这三种情况下拟南芥miRNAs/siRNAs的表达差异,确定了受Xcc诱导(或抑制)的候选非编码RNA,进一步应用q-RT-PCR和定量Northern杂交方法对这些差异表达以及新发现的候选非编码RNA进行验证后,我们最终成功地鉴定了7个受Xcc诱导的拟南芥miRNA以及81个新的拟南芥miRNA。这些研究结果为深入研究拟南芥非编码RNA在对抗Xcc侵染的防卫反应中的作用奠定了基础。
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DOI:--
发表时间:2011
期刊:基因组学与应用生物学
影响因子:--
作者:唐纪良
通讯作者:唐纪良
十字花科黑腐病菌一非编码RNA调控hrp基因表达的分子机理研究
- 批准号:31970124
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:60.0万元
- 批准年份:2019
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
十字花科黑腐病菌与致病相关的一个小RNA的作用机理研究
- 批准号:31470237
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:85.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
十字花科黑腐病菌致病性的调控机理研究
- 批准号:30730004
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:160.0万元
- 批准年份:2007
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
野油菜黄单胞菌的Csr全局调控系统及其在致病过程中的作用
- 批准号:30670024
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:30.0万元
- 批准年份:2006
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
野油菜黄单胞菌致病性的功能基因组学
- 批准号:30130010
- 项目类别:重点项目
- 资助金额:180.0万元
- 批准年份:2001
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
黄单胞菌与黄原胶合成有关的基因的分子克隆
- 批准号:39770421
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:12.0万元
- 批准年份:1997
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
黄单胞杆菌黄原胶产生的分子遗传学研究
- 批准号:39100064
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:3.0万元
- 批准年份:1991
- 负责人:唐纪良
- 依托单位:
国内基金
海外基金
