儿童急性呼吸道感染中新型鼻病毒(HRV-C)基因变异性研究

批准号:
81100005
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
22.0 万元
负责人:
宋靖荣
依托单位:
学科分类:
H0102.呼吸系统感染、炎症与免疫
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
林珍、亢娟、丁国栋、徐梅佳、吕伟、杨茜、路黎娟
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中文摘要
急性呼吸道感染发病率占所有急性传染病的首位,并已成为导致5岁以下儿童死亡的第二大病因,是儿童的主要公共健康问题之一。研究表明儿童急性呼吸道感染的病原体仍以病毒为主。申请人研究前期工作证实鼻病毒具有较高的感染率,同时存在新发现的C群,并为主要流行群,本研究采用RT-PCR和PCR方法检测常见呼吸道病毒RSV、HRV、IFV(A、B型)、PIV(I,II,III型)、ADV及新发现可能与呼吸道疾病相关病毒HMPV、HBOV,HCoV-NL63、HCoV-HKU1,同时进一步建立鼻病毒C群VP1片段扩增方法,目标在了解上海地区儿童急性呼吸道感染病毒病原谱的基础上,基于前期鼻病毒 VP4/VP2片段研究的基础,进一步延伸对于变异性更大的VP1片段进行相关研究,了解不同地区VP1变异情况,为进一步进行抗药性研究提供数据。
英文摘要
人鼻病毒是引起呼吸道感染的最常见病原,既往基于基因的遗传进化分析将HRV分为HRV-A和HRV-B两个群。2007年发现新的基因型HRV-C,目前对这种新发病毒了解较少。本研究期望了解上海地区HRV-C的临床及分子流行病特征及HRV-C变异情况,监测该地区儿童急性呼吸道感染的病毒病原谱,了解不同病毒的临床及分子流行病特征。我们收集2012年1月至2013年12月,在上海交通大学医学院附属第三人民医院,新华医院,普陀区中心医院因急性呼吸道感染就诊的643例患儿的鼻咽抽吸物标本,采用RT-PCR和PCR方法检测HRV、RSV、IFV(A、B型)、PIV(1-4型)、HMPV、HCoV-NL63, HCoV-HKU1、ADV、HBoV,并且分别采用RT-PCR和巢式PCR扩增HRV VP4/VP2基因片段和VP1基因片段,并对所有阳性产物并进行序列测定。本研究收集标本中,共检出病毒感染阳性标本369份,总检出率57.4%,其中HRV 检出率12.4%, RSV检出率12.9%, IFVA检出率1.1 %, IFVB检出率2.5% , PIV1检出率3.3%, PIV2检出率0.7%, PIV3检出率9.5%, PIV4检出率3.9%, ADV检出率15.3%,HMPV检出率4% , HBoV检出率10.2%, HCoV-HKU1检出率1.1%, HCoV-NL63未检出。HRV-C检出率3.3% ,核苷酸同源性在93%~100%之间. HRV-C有9例混合感染,其中5例混合感染HBoV,HRV-C年龄为2个月~3岁,中位年龄为9个月,所有患儿年龄均小于3岁。HRV-C的检出高峰出现在10月,临床诊断均为下呼吸道感染,临床症状无特异性,主要包括发热,咳嗽,咳痰,咽充血,喘息,肺部可及啰音或哮鸣音,部分伴有腹泻。本研究从80例HRV阳性标本中扩增出52例VP1基因片段,建立了HRV VP1片段扩增方法。本研究各阶段按计划进行,目前发表论文3篇。
期刊论文列表
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专利列表
DOI:--
发表时间:2014
期刊:中华传染病杂志
影响因子:--
作者:宋靖荣
通讯作者:宋靖荣
DOI:--
发表时间:2014
期刊:中国妇幼保健
影响因子:--
作者:徐梅佳;谢志萍;高寒春;叶剑敏;杨子珍;宋靖荣
通讯作者:宋靖荣
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