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智能响应性蛋白质冠的计算机模拟研究

批准号:
21376089
项目类别:
面上项目
资助金额:
80.0 万元
负责人:
周健
依托单位:
学科分类:
化工热力学
结题年份:
2017
批准年份:
2013
项目状态:
已结题
项目参与者:
何道航、乔智威、刘捷、彭春望、郭泓雨、董佳奇、杨川、赵道辉、全学波

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
蛋白质在纳米粒子表面自组装形成蛋白质冠的基础研究对生物传感和生物检测等领域中新技术的应用开发起重要作用。其中,关键的基础科学前沿问题是蛋白质在纳米粒子上组装的取向以及组装后蛋白质分子的构象变化。本研究拟开发新的蛋白质的粗粒化模型和并行退火蒙特卡罗算法来实现蛋白质在纳米粒子表面上吸附取向的快速准确的模拟预测,将采用分子动力学方法探讨温度、pH及离子强度等外部条件对相应智能响应性聚合物刷修饰的纳米粒子表面上蛋白质的组装与解组装的影响,并讨论纳米粒子曲率和蛋白质浓度等条件对蛋白质在纳米粒子表面自组装形成蛋白质冠的影响规律和机理。在分子水平上有关蛋白质冠可控组装与解组装的研究将为实现可保持蛋白质生物活性及生物功能的智能响应性蛋白质冠可控自组装体系的制备提供保障,并为蛋白质冠相关应用产品的设计和开发提供指导。
英文摘要
The formation of protein corona by the self-assembly of protein and nanoparticle plays an important role in the development of new technologies for biosensing and biodetection. The fundamental key scientific frontier issue is the self-assembly mechanism and the coarse-grained protein-nanoparticle interactions. Coarse-grained molecular dynamics simulations will be adopted to investigate the effects of temperature, pH and ionic-strength on the self-assembly and disassembly of smart responsive protein corona. The influence of curvature of nanoparticles and protein concentration on the self-assembly of protein corona will also be studied. The molecular understanding of controlled self-assembly and disassembly will provide guidance for the controlled preparation of protein corona and its practical applications.
蛋白质在纳米材料表面形成的蛋白质冠,对生物传感和生物检测等新技术的应用开发起重要作用。本研究采用多尺度分子模拟方法研究智能响应性对蛋白质与纳米材料形成的蛋白质冠的功能调控,探讨了pH、离子强度等外部条件对纳米粒子与蛋白质的自组装与解组装的影响,并讨论纳米粒子曲率对蛋白质在纳米粒子表面自组装形成蛋白质冠的影响规律和机理。本项目提出了蒙特卡罗与分子动力学相结合来研究蛋白质冠上蛋白取向与构象的多尺度模拟研究策略。研究发现酶的偶极是影响蛋白质在带电表面取向的关键因素。提出疏水偶极是影响蛋白质在中性表面吸附取向的重要因素。亲水性表面有较好的阻抗蛋白质吸附的特性。在针对该项目的研究中,已经在AIChE J、Chem. Eng. Sci.、ACS Nano.、Nanoscale、J. Phys. Chem. B/C、Phys. Chem. Chem. Phys.、Chem. Comm.、Langmuir、Soft Matter等期刊发表SCI、EI论文46篇,并有数篇入选国际期刊封面论文。在分子水平上有关蛋白质冠可控组装与解组装的研究将为实现生物功能导向的智能响应性蛋白质冠的制备提供保障,并为相关应用产品的设计和开发提供指导。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Computer simulation of bioenergy-oriented enzyme immobilization
生物能源导向酶固定化的计算机模拟
DOI: --
发表时间: 2014
期刊: CIESC Journal
影响因子: --
作者: [Zhao Daohui, Peng Chunwang, Liao Chenyi, Zhou Jian]
通讯作者: Zhou Jian
Understanding the curvature effect of silica nanoparticles on lysozyme adsorption orientation and conformation: a mesoscopic coarse-grained simulation study
了解二氧化硅纳米粒子对溶菌酶吸附方向和构象的曲率效应:介观粗粒度模拟研究
DOI: 10.1039/c6cp01478j
发表时间: 2016
期刊: Physical Chemistry Chemical Physics
影响因子: 3.3
作者: [Yu Gaobo, Zhou Jian]
通讯作者: Zhou Jian
A mechanical nanogate based on a carbon nanotube for reversible control of ion conduction
基于碳纳米管的机械纳米门,用于可逆控制离子传导
DOI: 10.1039/c3nr06238d
发表时间: 2014
期刊: Nanoscale
影响因子: 6.7
作者: [He Zhongjin, Corry Ben, Lu Xiaohua, Zhou Jian]
通讯作者: Zhou Jian
Advanced Monte Carlo simulations of the adsorption of chiral alcohols in a homochiral metal-organic framework
手性醇在纯手性金属有机骨架中吸附的高级蒙特卡罗模拟
DOI: 10.1002/aic.14415
发表时间: 2014
期刊: AICHE Journal
影响因子: 3.7
作者: [Qiao Zhiwei, Torres-Knoop Ariana, Dubbeldam David, Fairen-Jimenez David, Zhou Jian, Snurr R, all Q.]
通讯作者: all Q.
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    蛋白质在油水界面吸附的计算机模拟研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      15.0万元
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      周健
    • 依托单位:
    蛋白质在油水界面吸附的分子模拟研究
    • 批准号:
      22378134
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      50万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      周健
    • 依托单位:
    智能响应性两性离子聚合物防污膜的分子设计
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      10.0万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      周健
    • 依托单位:
    智能调控嵌段共聚物微相分离的计算机模拟
    • 批准号:
      21776093
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      64.0万元
    • 批准年份:
      2017
    • 负责人:
      周健
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金