水稻卷叶突变相关基因的表达谱及功能分析
结题报告
批准号:
31071070
项目类别:
面上项目
资助金额:
31.0 万元
负责人:
易继财
依托单位:
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2013
批准年份:
2010
项目状态:
已结题
项目参与者:
梅曼彤、杨跃生、周峰、彭宝富、李颖嫦
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中文摘要
水稻叶片适度卷曲在株型改良育种中有重要意义。迄今在水稻中已发现的卷叶相关调控因子为数不多,所获得的知识尚无法勾勒出水稻卷叶发育的分子调控途径。申请者以r射线诱导产生的水稻卷叶突变体rl10(t)为材料,利用Solexa高通量测序技术建立卷叶发育有关基因的差异表达谱,通过生物信息学挖掘,从整体水平认识水稻卷叶调控有关的基因表达种类以及基因间相互作用网络关系;发现重要基因,并通过定量PCR和RNA干涉技术研究这些基因的功能与水稻卷叶发育的关系,为深入探索水稻叶发育的分子机理奠定基础。
英文摘要
本课题通过RNA-seq测序及生物信息学分析,探讨水稻卷叶调控相关基因的表达种类及网络。结合定量PCR分析,筛选重要基因,并通过RNA干涉及过量表达技术研究这些基因的功能。取得结果为:1)通过对RNA-seq、基因芯片及CGH分析所得的数据进行生物信息学分析,鉴定到大量突变相关的差异表达基因,其中包含有生长素合成相关基因,譬如FMO类基因,以及与叶发育相关基因,譬如AGO类基因等。生物信息学分析表明,这些差异基因主要具有转录因子,运输,激酶,受体,水解以及核酸、蛋白质和脂的结合等活性,与逆境响应,刺激响应,信号传导,复制,蛋白质修饰,碳、脂及氨基酸的代谢等生物学过程相关。2)对116个表达差异显著的候选基因进行qPCR验证,鉴定到其中93个在突变体与原种间差异表达。3)对约20个叶发育相关基因进行RT-PCR分析,发现3个基因(即KNOX2、PHB1和BOLH1)在突变体中表达上调,以及2个基因(即AGO7和OSLG1)在突变体中表达下调。4)对候选基因A18、A31、A38、A43和B36的干涉发现可导致叶发育异常、结实率降低、分蘖增多及矮化的表型,而对候选基因A46和A49的过量表达则导致叶片变小、矮化及结实率降低的表型,推测这些基因对水稻生长发育包括叶发育具有非常重要作用。研究结果为进一步阐明这些基因功能及其调控卷叶的机理奠定了基础。
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Cloning, characterization and expression of OsFMO(t) in rice encoding a Flavin Monooxygenase (FMO)
编码黄素单加氧酶 (FMO) 的水稻中 OsFMO(t) 的克隆、表征和表达
DOI:--
发表时间:2013
期刊:Journal of Genetics
影响因子:1.5
作者:易继财
通讯作者:易继财
水稻低亲和性阳离子转运蛋白OsLCT3在 调控镉积累和耐性中的作用与机制研究
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
    易继财
  • 依托单位:
水稻硫素蛋白(thionin)基因抗镉的作用机制及应用研究
  • 批准号:
    n/a
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    10.0万元
  • 批准年份:
    2022
  • 负责人:
    易继财
  • 依托单位:
水稻叶面施硅调控籽粒镉积累的分子机理
  • 批准号:
    41877143
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    易继财
  • 依托单位:
与生长素相关的水稻卷叶突变基因克隆及功能分析
  • 批准号:
    30671279
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    24.0万元
  • 批准年份:
    2006
  • 负责人:
    易继财
  • 依托单位:
国内基金
海外基金