毛壳属是子囊菌中的一个分类疑难大属，属内全世界已记载有300多个种；而新的von Arx分类系统仅承认约119个种。准确把握自然物种的概念是其中亟待解决的关键问题。本项目将在前期研究的基础上，以属内6个争议焦点类群为突破口，深入研究和系统比较我国各个"种"的所有菌株与相关"种"的模式或权威菌株在表型性状上的共性和差异；同时结合分析其28S rDNA D1 / D2区、ITS区及18S rDNA序列，揭示彼此间的系统发育关系；科学评价子囊果和子囊果修饰毛等形态的变异性与稳定性间辨证关系及其分类学价值；从种群角度验证并重新修订目标类群的自然物种概念。在此基础上进一步研究我国各物种的蛋白表达谱特征，建立各研究物种的标准蛋白表达谱数据库，探索利用蛋白表达谱特征进行真菌系统学研究的新方法、新途径，为进一步研究科学开发我国毛壳属资源的应用潜力和有效控制其危害，提供直接的科学数据和基础。