食肉目动物位于食物链顶端，很多成员不仅在我国野生动物保护工作中占有重要地位，而且还是研究动物适应性进化遗传机制的重要模式生物。但是，围绕食肉目，特别是种类繁多且形态各异的熊超科物种的系统发育关系方面仍然不清楚。本研究拟采用进化生物学领域中广泛应用和日益完善的系统发育分析方法，整合线粒体和核基因多个基因序列信息来研究熊超科不同分类阶元（各科之间以及科内各物种之间）的系统演化历史。并与前人的数据信息相互结合和印证，构建可靠的熊超科分子系统树，澄清该类群系统与演化中长期倍受争议的进化难题，为进一步研究该类群适应性进化的内在机制奠定基础，同时通过筛选具有独立遗传特征的分子标记，特别是多个有效核基因序列，提出适用于熊超科（或其它动物类群）系统发育学研究的遗传标记，并探讨多基因序列的数据分析策略和方法，为中国的"生命之树"研究计划提供方法学上的经验。