木薯（Manihot esculenta Crantz）是世界三大薯类作物之一和我国发展燃料乙醇的重要原料。木薯抗旱能力突出，具备独特的抗旱调节机制，但木薯抗旱的机理尚未阐明。cDNA-AFLP是一种经济且高通量的筛选差异表达基因的实验技术，本研究提出的改良型cDNA-AFLP技术将解决其转录获得片段（Transcript-derived fragment,TDF）不能达转录起始位点的不足，使其TDF将多始于转录起始位点，包含5'UTR，且可方便地获得基因的全长cDNA。本研究将建立改良型cDNA-AFLP技术体系，并利用该技术筛选木薯品种间不同干旱胁迫处理样品的差异表达TDF。进而，对干旱诱导表达的TDF进行克隆，功能注释和时空表达验证，并克隆10-20个木薯抗旱相关基因的全长cDNA，为后续的功能验证和木薯抗旱机理的研究奠定基础。