课题基金 / 基金详情

大分子电子相关方法及在化学反应中的应用

批准号:
21103086
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
26.0 万元
负责人:
李伟
依托单位:
学科分类:
化学理论与方法
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
花书贵、张晨阳

项目摘要

结项摘要

项目成果

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中文摘要
本项目致力于发展用于大分子精确计算的电子相关方法- - 分子中的簇(CIM)方法,并将其应用于化学反应机理的研究。CIM的基本思想是在局域轨道表象下,把大分子的电子相关计算,分解为若干子体系的计算。针对大分子体系的化学反应研究,我们将发展基于Restricted Open-shell Hartree-Fock (ROHF)或Unestricted Hartree-Fock(UHF)的开壳层CIM方法,用于反应自由基中间体的二级多体微扰(MP2)和耦合簇(CC)计算;还将把CIM方法在闭壳层MP2水平上推广到解析能量梯度的计算,以用于大分子几何构型的优化;进一步采用对不同区域使用不同水平计算方法的多层CIM方法,研究酶反应的能垒和催化机理。我们期望该方法可以媲美量子力学/分子力学(QM/MM)组合方法,能够广泛应用于酶等生物大分子的全量子研究。
英文摘要
在本项目中,我们在前期工作的基础上,进一步发展改进了两种线性标度的量子化学方法,包括推广的基于能量的分块(GEBF)方法和基于局域轨道的分子中的簇(CIM)方法,并取得了一些显著进展:(1) 在GEBF方法框架下,将该方法与显式相关F12方法相结合,分别在MP2和耦合簇CCSD(T)水平上实现了大分子簇在基组极限下的精确计算,并结合多层次模型,计算了含几千个原子的超大分子簇。此外,还改进了GEBF梯度的计算精度,并用于生物大分子的超快从头算动力学模拟;(2) 在CIM方法框架下,通过引入中程电子相关、改进分子簇及虚轨道的构建等,使得该方法能够用于多种基组下的相对能量计算,精度和速度都比以前大大提高。改进的CIM方法适用于生物体系和金属氧化物在多种基组下的计算,其中后者目前难以使用GEBF处理。(3) 基于以上两种方法的发展,进一步完善了具有自主知识产权的量子化学程序 (Low Scaling Quantum Chemistry, 简称LSQC)。. 本项目的研究成果共发表论文9篇,其中项目负责人通讯作者或第一作者论文5篇,主要发表在国际重要期刊上,如J. Chem. Theory Comput.,J. Chem. Phys.,Phys. Chem. Chem. Phys.。项目负责人在国内或国际重要学术会议上作邀请或口头报告4次,并获得2014年中国化学会唐敖庆青年理论化学奖。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
Improved Cluster-in-Molecule Local Correlation Approach for Electron Correlation Calculation of Large Systems
用于大型系统电子相关计算的改进分子内簇局部相关方法
DOI: 10.1021/jp501976x
发表时间: 2014
期刊: Journal of Physical Chemistry A
影响因子: 2.9
作者: [Guo Yang, Li Wei, Li Shuhua]
通讯作者: Li Shuhua
DOI: 10.1039/c2cp23916g
发表时间: 2012-05
期刊: Physical chemistry chemical physics : PCCP
影响因子: --
作者: [Wei Li;Yang Guo;Shuhua Li]
通讯作者: Wei Li;Yang Guo;Shuhua Li
DOI: 10.1021/jp5020516
发表时间: 2014-07
期刊: The journal of physical chemistry. A
影响因子: --
作者: [Pingying Liu;Wei Li;Li Liu;Leyong Wang;Jing Ma]
通讯作者: Pingying Liu;Wei Li;Li Liu;Leyong Wang;Jing Ma
Generalized Energy-Based Fragmentation CCSD(T)-F12a Method and Application to the Relative Energies of Water Clusters (H2O)20
广义能量碎裂 CCSD(T)-F12a 方法及其在水团簇 (H2O)20 相对能量中的应用
DOI: 10.1021/ct401060m
发表时间: 2014
期刊: Journal of Chemical Theory and Computation
影响因子: 5.5
作者: [Kedong Wang, Wei Li, Shuhua Li]
通讯作者: Shuhua Li
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    TREM2/SCD4在蛛网膜下腔出血后调控小胶质细胞吞噬功能的机制研究
    • 批准号:
      82371344
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      49万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      李伟
    • 依托单位:
    基于电子相关方法的机器学习力场模拟软件开发
    • 批准号:
      22273038
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      54万元
    • 批准年份:
      2022
    • 负责人:
      李伟
    • 依托单位:
    CSF1/CSF1R调控小胶质细胞功能转化在蛛网膜下腔出血中的机制研究
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      55万元
    • 批准年份:
      2021
    • 负责人:
      李伟
    • 依托单位:
    应用EXAFS研究金属稳定同位素在矿物-溶液界面吸附反应的分馏机理
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      --
    • 资助金额:
      10万元
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      李伟
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金