选取药用植物五味子(Schisandra chinensis（Turcz.）Baill.)和南五味子(Schisandra sphenanthera Rehd. et Wils.)作为研究对象，利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记建立五味子和南五味子不同基因型的指纹图谱。研究五味子和南五味子种的遗传多样性和群体遗传结构，分析居群内和居群间的遗传变异，为五味子和南五味子资源的合理利用提供依据。在研究五味子和南五味子基因型变异的基础上，寻找五味子和南五味子的种特异性ISSR扩增片断，克隆、纯化后测定DNA序列，然后设计特异的扩增引物将其转化为SCAR(seqence characterized amplified region)标记，最终发展一种简单、实用的分子标记来鉴别五味子和南五味子，解决五味子和南五味子生药鉴别难的问题，辅助药材质量控制。