在深入研究“治理”的基本概念和内涵的基础上，将治理的思想引入到电子商务研究领域，提出了电子商务治理的概念，指出电子商务治理是为引导、控制和激励电子商务活动中的期望行为进行制度设计和构建的过程。同时，课题组从微观和宏观两个层面构建了电子商务治理的概念体系。其中，在微观层面的电子商务治理研究方面：提出了一个面向企业的电子商务治理概念框架，治理主体主要是电子商务企业或企业联盟，其治理域偏重于电子商务项目或活动中涉及到的服务、安全、用户、营销以及战略等问题，分析了其治理目标，构建了治理最佳实践库的框架。在宏观层面的电子商务治理研究中，重点对面向政府的电子商务治理概念框架进行了研究，宏观层面的电子商务治理的治理主体主要是政府监管机构，其治理域偏重于与电子商务相关的宏观政策、法律、规章与规则、信用制度、宏观的支付体系等问题；分析了宏观治理措施与电子商务生态链存在的复杂的相互作用关系；剖新了治理措施性质和功能的不同组合会产生治理对象的“挤进——逸出”现象。此外，利用ABMS建模仿真工具，设计、编码并构建了一个人工电子商务生态链用于电子商务治理政策的建模和仿真。基于该人工电子商务生态链，课题组通过构建计算实验模型，对电子商务对税收征管体系的影响进行了计算实验研究，发现电子商务导致的销售环节分散化、交易金额分散化和网络交易的无形化等特征将造成跨境或跨区交易的流转税向生产地少部分转移，同时造成所得税向生产地和电商公司所在地大部分转移，从而对所得来源地的税收形成巨大伤害，造成国家和地区间的税收分配越来越不平衡,造成税收利益分配不公平，需引起相关决策部门的高度重视。另外，构建了信用机制对电子商务治理影响的计算实验模型，研究并揭示了信用机制对引导、激励电子商务交易活动，降低交易成本的巨大作用。此外，还对Agent技术在旅游电子商务中的应用进行了一定的研究。