常染色体拥有丰富的遗传变异，其遗传信息含量远远超过mtDNA和Y-DNA，且常与人体中重要的功能基因相关联，但由于常染色体遗传变异位点传递的复杂性，目前数据分析方法还不成熟，其大规模应用于群体遗传结构研究中也还处于起步阶段。本项目旨在利用国际HapMap计划产生的大量SNP数据，应用近几年来发现的常染色体单倍域（Haplotype Block）结构，建立起一套完善的SNP数据分析方案，并发展一个适用于遗传结构研究的有效分析系统，选择代表性的中国人群，采用Tcqman等技术进行基因分型，来研究中国人群的遗传结构，并与其它遗传标记系统得到的结果进行比较，阐明中国各人群之间的遗传关系，揭示其起源、迁徙历史及融合过程。同时研究结果对于疾病发生机制研究及中国人群疾病的易感性研究和药物开发等工作也具有重要意义。