课题基金 / 基金详情

乳腺癌上皮间质转化中核苷酸代谢相关的功能蛋白发现和机理研究

批准号:
32070748
项目类别:
面上项目
资助金额:
54.0 万元
负责人:
戴凌云
依托单位:
学科分类:
细胞代谢、应激及稳态调控
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
戴凌云

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
上皮间质转化EMT与乳腺癌的浸润转移、耐药性发生有密切联系。EMT发生分子机制非常复杂,仍需要进一步的探究和阐明,需要新的研究角度和手段。我们前期利用新近开发的CETSA-IMPRINTS方法,得到了乳腺癌EMT过程中组学水平上的“在体”蛋白质的动态调节信息,并从中发现了包括胸苷酸合成酶TYMS和琥珀酰辅酶A合成酶SCS在内的若干个参与核苷酸代谢蛋白很可能在间质表型细胞中处于(加强)活化状态。考虑到越来越多的证据表明细胞代谢重编程与EMT的发生密切相关,靶向癌细胞的代谢途径将有可能成为逆转EMT从而控制癌症转移的新途径。本课题拟围绕这两个核苷酸代谢蛋白进行细致深入的细胞功能验证和生化分析,明确它们与EMT发生的相关性,理解其具体的分子作用机制,为乳腺癌EMT相关的代谢重编程机制研究提供理论和实验依据,最终为乳腺癌的治疗和干预提供潜在的新型功能蛋白靶点。
英文摘要
Epithelial-mesenchymal transition is closely related to the invasion, metastasis and the development of drug resistance in breast cancer. The underlying mechanisms of EMT activation are very complex and remain to be further studied and explored, probably with new research perspectives and tools. Recently we have applied the newly-developed CETSA-IMPRINTS methodology and got the proteome-wide information of the changes of “in situ” protein level and protein interaction states during the transition. Among these proteins with dynamic regulation, we found that two enzyme proteins––Thymidylate synthase (TYMS) and Succinate-CoA synthetase (SCS)––in the nucleotide metabolism pathway, are probably in the (enhanced-) activation state. Considering the accumulating evidence on the close relationship of metabolic reprogramming and the activation of EMT, it suggests that targeting the metabolic pathways of cancer cells could be a potential route for reversing EMT and controlling of metastasis in cancer therapy. In this proposal, we plan to carry out detailed functional characterizations and biochemical analyses on these two proteins, aim to confirm their roles in the activation of EMT and understand the underlying molecular mechanisms of action, thereby providing theoretical and experimental evidence for the metabolic reprogramming of breast cancer cells in EMT, eventually providing new potential functional targets for breast cancer therapy and intervention.
上皮间质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)与乳腺癌的浸润转移、耐药性发生有密切联系。EMT发生分子机制非常复杂,仍需要进一步的探究和阐明,需要新的研究角度和手段。我们前期利用新近开发的IMPRINTS-CETSA方法,得到了乳腺癌EMT过程中组学水平上的“在体”蛋白质的动态调节信息,并从中发现了包括胸苷酸合成酶TYMS和琥珀酰辅酶A合成酶SCS在内的若干个参与核苷酸代谢蛋白很可能在间质表型细胞中处于(加强)活化状态。考虑到越来越多的证据表明细胞代谢重编程与EMT的发生密切相关,靶向癌细胞的代谢途径将有可能成为逆转EMT从而控制癌症转移的新途径。本课题首先系统地分析了核苷酸代谢基因与乳腺癌进展预后的关系,使用机器学习算法构建核苷酸代谢Score来量化单个肿瘤的核苷酸代谢模式,并与肿瘤免疫微环境细胞浸润特征进行了系统关联;采用新近开发的IMPRINTS-CETSA方法,本课题还研究EMT过程中的蛋白状态改变,并结合代谢组学、细胞功能验证和生化分析等手段,重点围绕核苷酸代谢研究其与EMT发生的相关性,明确了TYMS蛋白水平与乳腺癌EMT过程的相关性;初步阐明了G-SCS酶活性、琥珀酰化修饰与乳腺癌EMT过程的相关性;课题还发展了针对IMPRINTS-CETSA数据的新算法和新软件,开发了IMPRINTS.CETSA软件和ShinyApp可视化操作界面;为乳腺癌EMT相关的代谢重编程机制研究提供理论和实验依据,最终为乳腺癌的治疗和干预提供潜在的新型功能蛋白靶点。部分研究内容已发表SCI论文8篇,其中包括Cell Systems、Briefings in Bioinformatics、Acta Pharmacologica Sinica等,并受邀在Medicinal Research Reviews发表综述论文,均已标注国自然基金号,另外申请了2项中国发明专利,均已获授权,完成了本项目要求的发表论文和申请专利的技术指标。
生物素合成途径介导的吡嗪酰胺抗结核治疗的靶标确证和机理研究
  • 批准号:
    82003814
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万元
  • 批准年份:
    2020
  • 负责人:
    戴凌云
  • 依托单位:
国内基金
海外基金