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中国华南地区人群HLA-DQ基因序列特异性甲基化诱导EBV免疫逃逸及鼻咽癌发生的前瞻性流行病学研究

批准号:
82073625
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
曹素梅
依托单位:
学科分类:
非传染病流行病学
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
曹素梅

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
华南地区人群EBV慢性感染率高,但其具体的病因机制尚不清楚。我们发现华南人群中鼻咽癌(NPC)易感基因HLA-DQ及其密切相关的HLA-II类基因的7个高甲基化区域有促进EBV慢性感染作用。因此提出HLA-DQ高危型易诱导临近的HLA-II类基因甲基化,造成CD4+T细胞功能下降,促进病毒慢性转化及NPC发生的病因机制假说。在多个EBV不同感染状态人群中,抽提鼻咽细胞DNA,使用包括850K、HLA芯片、Sanger和BSP测序等多组学技术,全面筛选EBV慢性感染的易感基因,CIT分析基因序列特异性甲基化(ASM)介导基因型与病毒感染的因果关系;通过复查筛查队列,前瞻性验证不同HLA-DQ基因型、ASM与EBV感染,基因表达及NPC的风险。本研究为阐明华南人群EBV慢性感染率高的病因机制提供高级别证据,为开展EBV感染相关癌症预防提供途径。
英文摘要
The rate of chronic EBV infection in the population in South China is high, but the specific etiology is not clear. We found that seven hypermethylated regions of the nasopharyngeal carcinoma(NPC) susceptibility HLA-II gene and its closely related HLA-DQ genes in the south China population have a role in promoting chronic infection of EBV. Therefore, we propose a hypothesis that HLA-DQ high-risk type can easily induce the methylation of adjacent HLA-II genes, causing the decline of CD4+ T cell function and promoting the chronic transformation of the virus and the occurrence of NPC. We plan to extract nasopharyngeal cell DNA from the patients with different EBV infection statuses and utilize multi-omics technologies including 850K methylation array, HLA Array, Sanger sequencing and high-throughput BSP sequencing to comprehensively screen susceptible genes and allele-specific methylation (ASM) for EBV chronic infection. Causal inference test will be performed to evaluate the causal relationship between ASM-mediated genotypes and viral infection. Risks of EBV chronic infection and NPC occurrence associated with HLA-DQ genotypes and ASM are prospectively verified based on previously established screening cohorts. The proposed study will provide high-level scientific evidence for elucidating the etiology of chronic EBV infection with EBV and provides an approach to prevent cancer-related to EBV infection.
鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma, NPC)是一种与EB病毒(Epstein-Barr Virus, EBV)密切相关的恶性肿瘤,其发生具有显著的地域性和遗传易感性。本项目以广东省鼻咽癌高发区人群为研究对象,基于全基因组关联分析(GWAS)、全基因组DNA甲基化芯片(850K)和基因-表观遗传互作分析,全面探讨鼻咽癌发生的遗传和表观遗传机制,以及EBV激活在其中的作用。首先,本研究通过Illumina ASA芯片检测了935例健康人群的遗传数据,结合EBNA1-IgA和VCA-IgA抗体水平,构建了遗传易感性评分模型,鉴定出与EBV激活密切相关的显著SNP位点。进一步结合1,181例鼻咽癌病例与健康对照的SNP数据,筛选出15个与EBV激活和鼻咽癌发生均相关的关键SNP位点,主要分布于HLA-G、HLA-A及HCG9等基因区域,其中最显著的位点为HCG9区域的AA_A_66_30018708。 在表观遗传学研究中,利用850K甲基化芯片分析了鼻咽癌患者和健康对照的鼻咽脱落细胞DNA甲基化水平,鉴定出3万多个差异甲基化位点。显著差异位点主要富集于Th17细胞分化通路和RAS信号通路。RNA-seq数据进一步验证发现,Th17通路的关键基因RORC、TGFB2及TGFB3在鼻咽癌中高表达,提示Th17细胞相关的免疫调控可能在鼻咽癌发生中发挥重要作用。 此外,项目揭示了遗传易感性位点与鼻咽癌差异甲基化位点的潜在关联,鉴定出4对显著的meQTL(如rs3893464-cg15533029和rs2523946-cg06032337)。进一步分析表明,这些差异甲基化位点与EBNA1 IgA水平及EB病毒DNA滴度显著相关,并且在鼻咽癌中表现为低甲基化状态,结合450K芯片验证结果表明cg06032337和cg24100841为鼻咽癌关键甲基化标志物。.综上,本项目从遗传、表观遗传及其与EBV激活的关系多个角度,系统揭示了鼻咽癌发生的分子机制,明确了Th17细胞分化通路和RAS信号通路在鼻咽癌中的重要作用,并筛选出多组与鼻咽癌相关的SNP和甲基化标志物,具有重要的科学意义和应用价值。这些发现为鼻咽癌的早期筛查、风险预测及靶向治疗提供了新的研究基础。整个项目在SCI杂志发表论文13篇,申请专利1项,培养研究生5名。
中和抗体gp42-IgG双向抑制EB病毒感染鼻咽上皮及B淋巴细胞降低鼻咽癌发病风险的前瞻性流行病学研究
  • 批准号:
    82373655
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    49万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    曹素梅
  • 依托单位:
HLA基因多态性介导的高危型EB病毒慢性感染及其交互作用与鼻咽癌发病关系的前瞻性流行病学研究
  • 批准号:
    81872700
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2018
  • 负责人:
    曹素梅
  • 依托单位:
EB病毒再激活与鼻咽粘膜早期癌变关系及其表观遗传学机制
  • 批准号:
    81373068
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    曹素梅
  • 依托单位:
国内基金
海外基金