本项目主要对抚仙湖及星云湖的水质进行了为期半年的监测，抚仙湖和星云湖均存在时空异质性，且受人类活动影响比较小的地区，水质较好，反之，则较差。在各项指标中，星云湖几乎均高于抚仙湖，其中，星云湖的Spcond约是抚仙湖的2倍，星云湖的藻蓝蛋白约是抚仙湖的21倍。星云湖东岸水质好于西岸水质。抚仙湖和星云湖的PH值均偏高。水温对气候有非常敏感的响应。总体来看，代表云南高原湖泊的抚仙湖和星云湖正向着不利于湖泊良性循环的方向发展。.通过对阳宗海表层样品中介形类的组合分析，发现表层样品中的介形类组合为Heterocypris incongruens、 Parachinocythere reticulata gen. et sp. nov. 、 Cypridopsis nigrovittata、 Potamocypris smaragdina、 Neovirgatocypris fuxianhuensis Huang et Yang sp.nov.、 Candona fuxianhuensis Huang et Yang sp.nov.和 Candona sp.。这些介形类的出现代表着浅水相，其丰度和分异度都不是很高，可见该湖盆不是介形虫的理想栖息地。不同深度表层沉积物中的介形类组合存在较大的变化，可以划分为浅、中、深水三个阶段。浅水以H. incongruens及C. nigrovittata为典型代表，丰度较高，分异度较低。中等水深以H. incongruens及P. reticulata 为典型代表，丰度和分异度均较低，与此同时中等水深的位置也是砷污染严重的地点。深水以P. reticulata 为典型代表，丰度和分异度均达到最高值。H. incongruens为阳宗海内的绝对优势种，但是丰度并不是很高。在阳宗海中发现的P. reticulata 大多数都集中在湖盆的中央远离近岸的位置，其丰度达到最高值。表明P.reticulata喜欢较深水。