MiR-9调控区域遗传变异与非小细胞肺癌预后的关联及其生物学功能的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81602021
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    16.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31
  • 项目参与者:
    陈波; 曹松玉; 张凯; 谢开鹏; 位云艳;
  • 关键词:

项目摘要

The five-year survival rate of lung cancer is less than 15% and characterized by individual variations. There have been so far very few reported about molecular markers that are able to evaluate prognosis of lung cancer. Studies have indicated that miRNA is involved in tumor development through regulating target genes. However, its single-nucleotide polymorphisms associated with lung cancer prognosis has been very few reported yet. We investigated the correlation between 88 important miRNA SNPs and prognosis of lung caner. The genotyping was performed by Illumina Infinium® BeadChip (Illumina Inc.). As a result, we found that the rs1501672 A>G, which is in the upstream of miR-9, demonstrated relatively strong correlation with the prognosis of lung caner. Based on the previous study, we are going to carry out the work as the following: First, Verify the changes of the expression of the miRNA are resulted from the above SNP’s modifications to the binding between the transcription factor and the promoter based on the EMSA. Second, explore further the regulating mechanism of the development of lung cancer prognosis affected by miR-9 SNPs regulating target gene. Eventually, the study will illuminate the relations and possible mechanisms between miR-9 SNPs and lung cancer prognosis, and provide theoretical evidences to the relevant markers of becoming the individualized evaluation for lung cancer prognosis and innovative ideas to the clinical individual treatments.
肺癌的5年生存率低于15%,且存在明显的个体差异,迄今能个体化评估肺癌预后的分子标志物甚少。研究表明miRNA通过对靶基因的调控参与了肿瘤的发生发展,但其调控区域SNPs与非小细胞肺癌预后的关联研究鲜有报道。我们利用外显子芯片技术通过1001例大样本病例研究,分析88个与肿瘤相关的重要miRNA调控区域SNPs与非小细胞肺癌预后的关联,结果发现位于miR-9上游的rs1501672 A>G与肺癌较好的预后相关。本课题拟在前期研究基础上通过①EMSA等方法来验证rs1501672 A>G通过改变转录因子HSF2与启动序列结合的能力,从而导致miR-9表达量的变化;②通过体内外实验探索miR-9通过对靶基因CDH1的调节影响肺癌发展预后的调控机制。最终阐明miR-9 SNPs与肺癌预后的关联及可能的生物学机制,为其成为个体化评估肺癌预后的分子标记物提供理论依据,为肺癌个体化治疗提供新的思路.

结项摘要

肺癌的5年生存率低于15%,且存在明显的个体差异,迄今能个体化评估肺癌预后的分子标志物甚少。研究表明miRNA通过对靶基因的调控参与了肿瘤的发生发展,但其调控区域SNPs与非小细胞肺癌预后的关联研究鲜有报道。我们利用外显子芯片技术通过1001例大样本病例研究,分析88个与肿瘤相关的重要miRNA调控区域SNPs与非小细胞肺癌预后的关联,结果发现位于miR-9上游的rs1501672(A>G)与肺癌较好的预后相关,位于miR-125b-1上游的rs2241490(G>A)与肺癌较差的预后相关,利用双荧光素酶报告基因发现位于miR-9-2上游调控区域的rs1501672(A>G)基因型改变可能影响了转录因子与miR-9-2上游启动序列的结合,从而改变了成熟miR-9量的表达,位于miR-125b-1上游的rs2241490(G>A)基因型改变潜在影响了转录因子与miR-125b上游序列结合改变了miR-125b的表达量。我们进一步利用生物信息学分析发现miR-9在肺癌组织中呈高表达,并绘制了以miR-9为中心的CeRNA网络,通过进一步分析发现潜在和miR-9结合的靶基因LIFR,及两条LncRNA(GVINP1、KIAA0087)在肺癌组织中表达量下降,与miR-9表达量负相关,而且LIFR、GVINP1、KIAA0087表达量升高与肺癌病人较好的预后相关;最后通过体内外实验进一步探讨miR-9表达量的失调可以影响肺癌细胞的增殖和侵袭能力,并在肺癌的发展及预后过程中的发挥作用。通过上述实验最终阐明microRNA SNPs与肺癌预后的关联及可能的生物学机制,为其成为个体化评估肺癌预后的分子标记物提供理论依据,为肺癌个体化治疗提供新的思路.

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic variants and the ceRNA network of miR-9 in the survival of non-small cell lung cancer patients
miR-9的遗传变异和ceRNA网络对非小细胞肺癌患者生存的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wu shuangshuang;Xu Jiali;Shenwei;Ma hongxia;Wu jianqing
  • 通讯作者:
    Wu jianqing
Genetic variations in miR-125 family and the survival of non-small cell lung cancer in Chinese population
miR-125家族遗传变异与中国人群非小细胞肺癌生存
  • DOI:
    10.1002/cam4.2073
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    CANCER MEDICINE
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Wu,Shuangshuang;Shen,Wei;Wu,Jianqing
  • 通讯作者:
    Wu,Jianqing
Functional Variant in 3 ' UTR of FAM13A Is Potentially Associated with Susceptibility and Survival of Lung Squamous Carcinoma
  • DOI:
    10.1089/dna.2019.4892
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    DNA and Cell Biology
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Yu Yuhui;Mao Liping;Lu Xiao;Yuan Weiyan;Chen Yujia;Jiang Liying;Li Ding;Sang Lingli;Xu Zhengcheng;Tian Tian;Wu Shuangshuang;Zhuang Xun;Chu Minjie
  • 通讯作者:
    Chu Minjie
The miR-608 rs4919510 polymorphism may modify cancer susceptibility based on type
miR-608 rs4919510 多态性可能会根据类型改变癌症易感性
  • DOI:
    10.1177/1010428317703819
  • 发表时间:
    2017-06-27
  • 期刊:
    TUMOR BIOLOGY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wu, Shuangshuang;Yuan, Weiyan;Chu, Minjie
  • 通讯作者:
    Chu, Minjie

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其他文献

线性与非线性多糖对鸡肉肌原纤维蛋白凝胶特性的影响
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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中药活性组分抗肺癌的功能与机制的研究现状
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    陈从贵
miRNA-200a调控FOXC1增敏肺癌EGFR-TKI治疗的研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    吴双双;梁耀珍;俞英
  • 通讯作者:
    俞英

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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