本项目以5个藏绵羊生态群体（甘肃3个群体和青海2个群体）为研究对象，克隆测定藏绵羊DQA和DQB座位基因序列并进行生物信息学分析，采用实时荧光定量PCR技术检测DQA1、DQA2、DQB1和DQB2基因mRNA在18月龄甘南藏绵羊背最长肌等17个组织中的相对表达量，以及利用 PCR-SSCP技术分析DQA1、DQA2、DQB1和DQB2基因遗传特征，以期揭示其与藏绵羊高原适应性进化的机制。主要研究结果及结论如下：.1.藏绵羊DQA和DQB基因CDS区片段长度分别为768bp和786bp，分别编码255和261个氨基酸，预测发现DQA和DQB蛋白均属分泌蛋白且具有较强的亲水性；DQA蛋白主要在内质网、高尔基体和细胞膜中发挥作用，而DQB蛋白则主要存在于细胞外、细胞膜和内质网中；二级结构均是无规则卷曲和α-螺旋为主的混合型。.2.DQA和DQB座位的4个基因在藏绵羊背最长肌、大脑、肺和肝等组织中均有表达，但表达水平具有组织特异性。.3.对随机采自甘肃和青海的5个群体的987只藏绵羊基因组DNA样品进行PCR-SSCP群体检测和分析后，发现DQA和DQB座位的4个基因均为多态，且4个多态基因共含有59个单倍型序列，其中，DQA1基因为17个，DQA2基因为16个，DQB1基因为5个，DQB2基因为21个。 与其他哺乳动物相比，藏绵羊的MHC Ⅱ类基因具有丰富的多态性。.4.平衡选择是维持藏绵羊DQA和DQB座位基因多态性的主要机制之一。DQA和DQB座位的4个基因的抗原结合位点（ABS）的非同义突变率高于同义突变率，说明藏绵羊DQA和DQB座位的4个基因均受到了平衡选择的作用。.5.重组是藏绵羊DQA座位基因的主要进化模式之一，藏绵羊DQB座位基因中未发现重组事件。在DQA1等位基因序列中检测2个重组事件，而在DQA2基因检测到4个重组事件。.6.基于MHCⅡ类DQA和DQB座位基因分化系数表明，甘加型藏绵羊与其他4个群体的分化显著。根据AMOVA分析结果，将5个藏绵羊群体依据地理位置划分为2个区域，即甘肃群体（OLX、QKX和GJX）和青海群体（QHOLX和QHGYX），表明甘肃和青海5个藏绵羊生态群体区域之间的变化大于同一区域不同群体间的变化，结果也支持了此区域的划分。