本课题以205头白色杜洛克×二花脸资源家系F2公猪群体为研究材料，在初步定位的QTL区间内增加14个SNP标记对该群体进行扫描以精细定位QTL；通过基因型填补获得该205头F2公猪个体的60K SNP结果后进行全基因组关联性（GWAS）分析；在精细定位QTL区间内和GWAS最显著SNP位点两侧，结合比较基因组学和基因功能注释信息，课题组筛选了雄性增强抗原1（MEA1）、端粒酶关联蛋白1（TEP1）、腺苷酸二磷酸核糖聚合酶-2（PARP-2）和周期蛋白B1 结合蛋白1（CCNB1IP1）4个位置候选基因，开展了这4个基因与公猪繁殖性状的关联性分析。结果表明：（1）精细定位使7号染色体上影响附睾重QTL的置信区间由原来的24.5 cM缩小至15 cM，F值由原来的23.76上升至45.24；7号染色体上另一个影响血浆睾酮浓度的QTL置信区间由原来的70.5 cM缩小至33 cM，F值由原来的10.68上升至14.87。（2）GWAS分析后共在8条染色体上发现了26个与附睾重、精子密度、总精子数等公猪繁殖性状极显著相关的SNP位点，其中位于7号染色体上的SNP位点有19个。（3）候选基因关联性研究表明：①MEA1基因的5个SNPs与公猪附睾重、血浆睾酮浓度和射精量极显著或相关；G-C-C-G-C单倍型与左、右侧附睾重极显著相关，A-C-C-G-G单倍型与左、右侧附睾重显著相关（P < 0.05）；F-drop分析显示MEA1基因的g.-1 168 A>G和g.1 115 A>G位点可能为影响公猪血浆睾酮浓度的主效突变位点（QTN）或与QTN紧密连锁。②TEP1基因的9个SNP位点和3个单倍型与公猪精液品质相关性状极显著或显著相关。③PARP2基因的15个SNP（部分SNP互相连锁）位点和5个单倍型与公猪精液品质相关性状极显著或显著相关。④CCNB1IP1基因的10个SNP位点和1个单倍型与公猪精液品质相关性状极显著或显著相关。结论：通过QTL精细定位和GWAS，课题组显著缩小了之前初步定位的7号染色体上影响公猪附睾重和血浆睾酮浓度QTL的置信区间；筛选了4个与F2公猪繁殖性状表现出强关联性的位置候选基因，鉴别到了两个可作为选育性欲较强公猪的分子标记。