基于大规模混合整数线性规划的计算生物酶设计的研究
批准号：
20776075
项目类别：
面上项目
资助金额：
30.0 万元
负责人：
朱玉山
依托单位：
学科分类：
介科学与智能化工
结题年份：
2010
批准年份：
2007
项目状态：
已结题
项目参与者：
何小荣、王杭州、王如强、胡益炯、金瑶华、张玉坤
项目摘要
结项摘要
项目成果
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中文摘要
计算机辅助化学产品设计是化学产品工程研究的核心内容。本申请在数学规划方法基础上探索建立同时考虑蛋白质侧链堆积及底物与酶活性位点分子对接的计算生物酶设计模型，并发展高效的组合优化算法求解对应的大规模混合整数线性规划问题。通过具体分析蛋白质折叠稳定性的要求及设计特定的活性位点结构赋予所设计的蛋白质所需要的功能，逐步解决蛋白质产品设计中结构和功能的复杂关系，从而达到通过序列的改变提高生物酶催化剂功能的要求。本申请将探索通过计算生物酶设计的方法增强枯草杆菌蛋白酶的低温适应性，降低洗涤温度，从而大大降低洗涤工业的能耗，并有望进一步推动生物节能技术在化学工业中的应用。
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Branch-and-Cut Algorithmic Framework for 0?1 Mixed-Integer Convex Nonlinear Programs
0?1混合整数凸非线性规划的分支切割算法框架
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DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
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混合整数非线性系统优化问题的改进分支割算法
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DOI：
10.1002/aic.11616
发表时间：
2008
期刊：
Aiche Journal
影响因子：
3.7
作者：
[Yushan Zhu, Yijiong Hu, Hao Wu, M. Nakaiwa]
通讯作者：
M. Nakaiwa
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
计算机与应用化学
影响因子：
--
作者：
[张玲玲, 巴丽娜, 林章凛, 朱玉山]
通讯作者：
朱玉山
A fast protein-ligand docking algorithm based on hydrogen bond matching and surface shape complementarity
基于氢键匹配和表面形状互补的快速蛋白质-配体对接算法
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DOI：
10.1007/s00894-009-0598-7
发表时间：
2010-05
期刊：
Journal of Molecular Modeling
影响因子：
2.2
作者：
[Zhu, Yushan, Pei, Jianfeng, Luo, Wenjia]
通讯作者：
Luo, Wenjia
计算机辅助的头孢菌素C酰化酶的从头设计
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批准号：21476123
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项目类别：面上项目
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资助金额：80.0万元
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批准年份：2014
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负责人：朱玉山
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依托单位：
基于大系统优化的CPC酰化酶的计算设计及实验验证
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批准号：21276136
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项目类别：面上项目
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资助金额：80.0万元
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批准年份：2012
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负责人：朱玉山
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依托单位：
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批准号：20976093
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项目类别：面上项目
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批准年份：2009
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负责人：朱玉山
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依托单位：
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批准号：20506013
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项目类别：青年科学基金项目
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资助金额：22.0万元
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批准年份：2005
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负责人：朱玉山
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依托单位：
国内基金
海外基金