副新翅类Paraneoptera是啮虫目、虱目、缨翅目和半翅目四类昆虫的合称，对其间系统发育关系及啮虫目和虱目各自单系性的认识，近年来只在对完全变态类昆虫和昆虫纲基部分支类群的研究中有附带涉及且意见不一。半翅目是副新翅类中最大的目和昆虫纲中第5大目，其内部亚目间关系及蝽类昆虫中的次目间关系均有待澄清。已有研究结果主要依据18S rRNA的部分而非全长序列信息，并且对于长度扩展区段对分子序列比对及系统发育结果的影响未予考虑，而这两者都严重影响结果的可靠性。本研究将对副新翅类昆虫18S rRNA全长的二级结构建立模型、指导比对结果的校正，进行副新翅类目级分类单元间的全面系统发育分析,此外以线粒体基因组分析目之间关系和半翅目中亚目间关系以及蝽类昆虫中的次目间关系，这两部分工作中Genbank缺少的数据将在本研究进行补充。结果的可信性将以贝叶斯合意和自展检验、布莱默衰减等方法进行评价。