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Cajal body重构染色质三维结构促进肝癌发生的作用和机制研究

批准号:
82060512
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
34.0 万元
负责人:
王秋雁
依托单位:
学科分类:
肿瘤发生
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
王秋雁

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
基因的正确表达调控需要在染色质折叠成的复杂三维结构中完成。肿瘤发生过程中染色质结构变化与基因表达的关系还十分不清。我们前期研究发现,细胞核体Cajal bodies(CBs)与组蛋白、核小分子RNA区域高度相关,形成独特三维非随机结构,调节肿瘤相关基因表达。肝癌细胞高表达CBs,下调CBs导致组蛋白基因簇HIST1三维互作破坏及表达降低。CBs在原代细胞不表达,但原癌基因可快速促进CBs产生,并引起HIST1空间位置改变及转录激活。本项目拟构建肝细胞原癌基因诱导表达动态模型,结合CRISPR/Cas9 基因编辑、DNA-FISH、高通量染色质构象捕获Hi-C 、RNA-seq和Chip-seq 等技术研究CBs在肿瘤发生中的作用,从全新的角度阐明CBs通过重构染色质三维结构调节基因表达,促进肝癌发生。本项目将为临床预防和控制肝癌提供新的分子靶点,也为细胞核体研究提供新的理论依据。
英文摘要
The dynamic and complex three-dimensional genomic interactions in the nucleus exert critical roles in regulated gene expression. We do not yet understand the changes in nuclear and genomic organization that lead to cancer transformation and progression. Recently Cajal bodies have been found to be associated frequently with histone and small nuclear RNA locus and they are formed into a unique three-dimensional non-random positioning to regulate tumor-related gene expression. Our previous study found that CBs are highly expressed in hepatoma carcinoma cells (HCC). Disassembly of CBs suppressed the expressions of histone HIST1 gene cluster, which play an essential role in maintaining HCCs function. CBs normally are absent in healthy primary cells but appear rapidly and universally after cancer gene transformation, which suggest that CB might be an early event of tumorigenesis. We propose to use inducible CB formation model system in Primary hepatocytes to examine the dynamic reorganization of nuclear architecture during cancer gene transformation. By using CRISPR/Cas9, DNA FISH, high-throughput chromosome conformation capture Hi-C, RNA-seq and GoldCLIP, we aims to study the function and significance of Cajal bodies in the process of proto-oncogene transformation of hepatocellular carcinoma cells. We will provide new evidence for the study of nuclear bodies.
Cajal body是细胞生物学研究中备受关注的一类无膜核体,调节神经干细胞发育。这个在神经细胞发现的细胞核体,为什么在肿瘤细胞高表达,一直被认为是细胞生物学悬而未解的“黑洞”。本项目前期发现肝癌细胞高表达细胞无膜核体Cajal body,并可能通过染色质三维调控影响肝癌细胞基因表达。本研究通过原癌基因转化技术,在正常人肝上皮细胞(THLE2)中构建了肝细胞癌原癌转化模型,结合高通量RNA测序技术和单细胞质谱流式技术,发现了与原癌转化和Cajal body功能密切相关的小RNA HOXA-AS2;结合CRIPSR/Cas9、RNA-seq、Hi-C 、多色免疫荧光等实验技术探讨了Cajal body在肝癌细胞中与组蛋白基因簇的相互作用,阐明了其与组蛋白转录后处理体(HLBs)之间存在密切的功能性联系。此外,基于Cajal body相关基因表达模式对广西区域高发肿瘤HCC人群队列进行分子分型,发现Cajal body活跃型肝癌与肿瘤恶性度、免疫逃逸、肿瘤干性和代谢重编程等特点紧密相关,提示Cajal body可能与肿瘤微环境相互作用,在HCC发生发展过程中起重要作用。继而结合单细胞测序等多组学技术全面探讨了Cajal body活跃型HCC的分子特征和肿瘤微环境特征;通过分子生物学实验验证了Cajal body核心基因Coilin和WRAP53在肝癌发生发展中的细胞生物学功能和调控作用,并通过eGFP-Coilin野生型和相分离关键位点K496E突变型的过表达肝癌细胞株,建立了Cajal body凝聚体动态改变的细胞模型,初步揭示了液-液相分离机制在Cajal body形成中的关键角色,以及对肝癌细胞药物敏感性和氧糖剥夺响应的影响及潜在分子机制。本项目将为临床诊治广西区域高发肝癌提供新的分子靶点,也为细胞核体研究提供新的理论依据。
ERAD抑制剂调节肿瘤细胞凋亡的表观遗传学机制研究
  • 批准号:
    31560311
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万元
  • 批准年份:
    2015
  • 负责人:
    王秋雁
  • 依托单位:
细胞核体Cajal bodies和小分子非编码RNA在肿瘤干细胞中协同调节基因簇的形成
  • 批准号:
    31471271
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    85.0万元
  • 批准年份:
    2014
  • 负责人:
    王秋雁
  • 依托单位:
国内基金
海外基金