基于蛋白质液晶化定向排列芯片的RDC核磁样品制备新方法研究
批准号:
21705161
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
胡锐
依托单位:
学科分类:
谱学方法与理论
结题年份:
2020
批准年份:
2017
项目状态:
已结题
项目参与者:
段谟杰、朱江、梁春杰、李双利、聂瑶、王梓
中文摘要
测定残余偶极耦合(RDC)辅助溶液中蛋白质结构解析的研究日益增多。一方面,RDC的大小取决于测定的两个原子核间的距离;另一方面,RDCs可以确定溶液中蛋白质的不同二级结构单元或不同结构域之间的相对取向。尽管测定RDCs的核磁共振(NMR)方法和用于获取不同残余程度的介质的研究已很广泛,然而RDC样品制备时存在着操作复杂、耗时和成功率低等问题。针对这些问题,本项目拟建立一种适用于RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片,利用“Y-ear”型非对称微结构混合器使溶液中的蛋白质在RDC液晶相介质中实现快速、均一、稳定和可控的定向排列,建立高效和自动化的NMR/RDC样品制备新方法。该新方法将应用到人体内胰岛素瘤相关蛋白INSM1截短体ZF1-3(包含3个锌指结构域)的RDCs测量。本课题对NMR/RDC样品制备方法的开拓性发展,将进一步推动溶液中生物大分子的NMR结构研究。
英文摘要
Investigations of the residue dipolar coupling (RDC) measurement for protein NMR structure determination have greatly increased. On one hand, the RDC depends on the distance between the two measured nuclei; on the other hand, RDCs from a specific bond can define the relative orientation of two secondary structural elements or two domains in the protein under study. Despite the extensive developments for RDC measurement using NMR spectroscopy and various RDC media designed for protein molecule arrangement, the preparation of the NMR sample for RDC measurement is complex, time-consuming and easy for failure. To solve these problems, a new method is proposed here to develop a liquid crystalline media microfluidic system for the preparation of RDC measurement samples. Using the "Y-ear" type asymmetric microstructure mixer to inject the protein solutions homogenously with a fixed orientation in the RDC liquid crystal phase, this new efficient and automated method is expected to be more rapid,homogeneous, stable and controllable. Furthermore, this new technique will be used to obtain the RDCs from INSM1 ZF1-3, a truncated version of human Insulinoma-associated protein INSM1, which contains three zinc fingers ZF1, ZF2 and ZF3. This pioneering method for sample preparation for RDC measurements will promote NMR structure analysis for macromolecules in solution.
测定残余偶极耦合(RDC)辅助溶液中蛋白质结构解析的研究十分重要,尽管测定RDCs的核磁共振(NMR)方法和用于获取不同残余程度的介质的研究已很广泛,然而RDC样品制备时存在着操作复杂、耗时和成功率低等问题。针对这些问题,本项目建立了一种适用于RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片。利用优化后的鱼钩型非对称微结构混合器使溶液中的蛋白质在RDC液晶相介质中实现快速、均一、稳定和可控的定向排列,建立高效、快速、可控的自动化NMR/RDC样品制备新方法。主要研究内容包括:(1)构建了微流控混合器,优化了自动温控系统和进样控制系统;(2)制备了多种RDC介质和蛋白溶液的混合液晶相,并通过核磁一维谱和二维谱对混合效果进行表征。我们按照项目计划开展相关研究工作,顺利研制出了基于液晶微流体混合器的RDC核磁样品制备的蛋白质液晶化定向排列芯片,制备了多种RDC介质和蛋白溶液的混合液晶相,并应用于人体内胰岛素瘤相关蛋白INSM1截短体ZF1-3(包含3个锌指结构域)等蛋白质的结构研究中。
期刊论文列表
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Safety analysis of edible oil products via Raman spectroscopy
通过拉曼光谱分析食用油产品的安全性
DOI:
10.1016/j.talanta.2018.08.074
发表时间:
2019-01-01
期刊:
TALANTA
影响因子:
6.1
作者:
[Hu, Rui, He, Ting, Liu, Maili]
通讯作者:
Liu, Maili
3D hydrodynamic flow focusing-based micromixer enables high-resolution imaging for studying the early folding kinetics of G-quadruplex
基于 3D 流体动力流动聚焦的微混合器可实现高分辨率成像,用于研究 G-四链体的早期折叠动力学
DOI:
10.1016/j.snb.2019.05.026
发表时间:
2019-08-15
期刊:
SENSORS AND ACTUATORS B-CHEMICAL
影响因子:
8.4
作者:
[Hu, Rui, Liu, Chao, Yang, Yunhuang]
通讯作者:
Yang, Yunhuang
NMR研究乳酸化TGIF1调控TGF-β/Smad信号转导通路的分子机制
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批准号:22374155
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:胡锐
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依托单位:
国内基金
海外基金