课题基金 / 基金详情

有约束多项分布转录因子结合位点识别

批准号：
60705004
项目类别：
青年科学基金项目
资助金额：
20.0 万元
负责人：
刘立芳
依托单位：
西安电子科技大学
学科分类：
模式识别与数据挖掘
结题年份：
2010
批准年份：
2007
项目状态：
已结题
项目参与者：
霍红卫、李青、郝红霞、郑海红、尚荣华、侯翠琴、张文革、史加荣、李晗
关键词：
motif识别机器学习.转录因子结合位点P-value

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项目成果

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中文摘要
本项目研究转录因子结合位点的"从头"识别问题。首先构建有约束多项分布motif模型，以实验统计为参考，充分考虑motif内各位点之间的相关性，以及模体的局部构象信息，增强motif模型描述生物学特征的准确性；其次研究基于有约束多项分布motif模型的机器学习问题，建立Gibbs抽样、现代进化算法、辅助生物信息有机融合的混合学习算法，着重提高对于长序列和特征微弱motif识别的准确程度；为了提供可靠的统计显著性评价，研究转录因子结合位点的分布特征，设计熵值P-value的渐进逼近的数值计算方法，提高计算的精确度并降低计算的时间复杂度，并探讨P-value与识别准确程度之间的相关性。本项目给人们进一步理解基因表达调控网络提供了一种非常有效的辅助手段，对于研究基因的调控是有重要意义的。
英文摘要
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
直接支持向量机
DOI： --
发表时间： --
期刊： 杜喆,刘三阳.直接支持向量机，控制与决策，23（8）937-941. 2008.
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Moitf GibbsGA: Sampling Transcription Factor Binding Sites Coupled with PSFM Optimization by Genetic Algorithm
Moitf GibbsGA：转录因子结合位点采样与遗传算法 PSFM 优化相结合
DOI： 10.4156/jcit.vol5.issue10.18
发表时间： 2010
期刊： J. Convergence Inf. Technol.
影响因子： --
作者： [Lifang Liu, Licheng Jiao]
通讯作者： Licheng Jiao
最小二乘支持向量机变型算法研究
DOI： --
发表时间： --
期刊： 西安电子科技大学学报, 2009, 36(2), 31-337 (EI: 20091912076954 )
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
直接支持向量回归机
DOI： --
发表时间： --
期刊： 系统工程与电子技术, 2009, 31(1), 178-181(EI: 20090811917518)
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 22 条
    非理想条件下无人集群高精度协同定位与导航算法研究
    • 批准号：
      62373291
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      50万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      刘立芳
    • 依托单位：
      西安电子科技大学
    国内基金
    海外基金