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外胚层特异性增强子Ect2在小鼠胚胎发育过程中的功能和机制研究
结题报告
批准号:
31900454
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
25.0 万元
负责人:
杨贤法
学科分类:
C0602.基因表达及非编码序列调控
结题年份:
2022
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
--
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中文摘要
小鼠早期胚胎在外源信号、内源因子及表观遗传调控的综合作用下,从具有多能性的上胚层特化形成外、中、内三个胚层。在该过程中,调控元件及其活性状态发挥着重要的调控作用。我们前期的研究鉴定出一个外胚层特异性增强子Ect2,然而其在小鼠胚胎发育中的功能和作用机制还不清楚。为研究增强子Ect2的体内功能及作用机制,我们构建了Ect2敲除小鼠胚胎干细胞系和小鼠品系,以及Ect2-pHsp68-CreERT2和Ect2-pHsp68-turboGFP转基因小鼠品系。本项目旨在通过对Ect2敲除小鼠胚胎干细胞及不同发育阶段胚胎的表型分析,阐明该增强子在小鼠胚胎发育过程中的作用,明确并验证增强子Ect2的调控网络和作用机制;通过对转基因小鼠中Ect2阳性细胞谱系的追踪,解析外胚层细胞谱系命运决定过程的分子机制。项目成果将大大加深人们对哺乳动物早期胚胎发育过程及调控机制的认识。
英文摘要
The early embryonic development of vertebrates is tightly regulated by multiple factors. Under the coordinated action of exogenous signals, endogenous factors and epigenetic regulation, embryos are gradually specialized from the pluripotent epiblast cells to form three germ layers of the ectoderm, mesoderm, and endoderm. It has been reported that the chromatin states of regulatory elements play critical roles in the establishment of cell lineage and the determination of germ layer fate. Our previous study identified an enhancer-Ect2, which exhibits ectoderm-specific activity in the gastrula, and exhibits severe neural differentiation abnormalities in Ect2 knockout embryonic stem cells. However, how Ect2 functions in vivo and how Ect2 affects neural differentiation still remain largely unknown. To answer this question, we have established Ect2 knockout mouse stem cell lines, knockout mouse lines,Ect2-Hsp68 minimal promoter-CreERT2 and Ect2-Hsp68 minimal promoter-turboGFP transgenic mouse lines. In this project, we aim to elucidate the in vivo role and functional mechanism of Ect2 enhancer by analyzing the transcriptomic and epigenomic changes from Ect2 knockout stem cell and mouse embryo; depict the development hierarchical tree of ectoderm lineage by tracing the Ect2 enhancer positive precursor cells. The result of this project will broaden the current understanding of mammalian early embryonic development and related regulatory elements-mediated regulatory networks.
小鼠早期胚胎在外源信号、内源因子及表观遗传调控的综合作用下,从具有多能性的上胚 层特化形成外、中、内三个胚层。在该过程中,调控元件及其活性状态发挥着重要的调控作用 。本项目针对我们前期的研究鉴定的一个外胚层特异性增强子Ect2,综合利用基因编辑干细胞技术、转基因小鼠制备技术、二代测序技术及高通量生物信息学分析等手段,揭示了调控元件Ect2在小鼠胚胎发育过程中的活性变化规律;阐明了调控元件Ect2在小鼠胚胎干细胞神经命运决定过程中的关键作用;并结合基因回补、敲降等技术,全面解析了Ect2可以通过调控2510009E07Rik基因的表达,并进一步影响Otx2, Nestin 等基因的表达,实现对神经命运决定过程的调控的分子作用机制。该项目的研究成果进一步加深了对哺乳动物早期胚胎发育过程及调控机制的认识。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI:10.21769/bioprotoc.4229
发表时间:2021
期刊:BIO-PROTOCOL
影响因子:0.8
作者:Xianfa Yang;Yingying Chen;Lu Song;Ting Zhang;Naihe Jing
通讯作者:Naihe Jing
Distinct enhancer signatures in the mouse gastrula delineate progressive cell fate continuum during embryo development
小鼠原肠胚中独特的增强子特征描绘了胚胎发育过程中渐进的细胞命运连续体
DOI:10.1038/s41422-019-0234-8
发表时间:2019
期刊:Cell Res
影响因子:--
作者:Xianfa Yang et. al.;Naihe jing
通讯作者:Naihe jing
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