本研究以我国epichloë内生真菌为中心，（1）利用已有引物检测菌株的NRPS基因，弄清了各类NRPS基因在这些菌株中的分布特征；（2）自行设计新引物，调查了sidC和sidD等新NRPS基因的存在；（3）与互联网公共资源比较国内外epichloë内生真菌菌株NRPS基因的异同，推测了我国产epichloë内生真菌的有益和有害次生代谢物的生产潜力，为判断宿主/内生真菌共生体的安全性提供了可靠的数据；（4）通过全面比较和分析各类菌株NRPS基因序列的特征，研究了各类epichloë内生真菌特异性NRPS基因，发现NRPS8在鹅观草内生真菌菌株中普遍存在，而在其宿主植物中没有检测到。因此，这个NRPS基因能成为检测鹅观草内生真菌的特异性探针。本研究还发现我国epichloë内生真菌NRPS基因的有无和分布可成为分析遗传多样性、区分近缘菌株的工具。