尽管头孢曲松耐药淋球菌已经在全球多个国家出现，但迄今淋球菌对头孢曲松耐药的分子机制仍未完全阐明。为全面阐明淋球菌对头孢曲松耐药的分子机制，我们运用头孢曲松次抑菌浓度法体外诱导WHO标准株A~E，选择诱导后对头孢曲松耐药的菌株，对已知的与头孢曲松耐药相关的penA、ponA、mtrR、penB、gyrA、parC基因进行PCR扩增及测序，并进一步进行诱导前后耐药菌株的基因组和转录组差异分析。结果D株（MIC 0.016→4.096）转变为稳定的头孢曲松耐药株，出现penA（A501V）突变。对D株进行诱导前后基因组和转录组差异分析，我们再次验证了诱导后D株出现头孢曲松耐药与penA基因突变有关，此外，还发现了多个以往从未有报道的淋球菌中头孢曲松耐药相关基因，包括ABC transporters（利用ATP进行跨膜转运的膜融合蛋白）、FarB（构成FarAB-MtrE外排系统）、ExbB（高浓度诱导耐药相关）、Hfq（RNA结合蛋白）和PilQ（PilQ多聚体形成微孔）的编码基因，其中ABC transporters、FarB、ExbB和Hfq的编码基因表达上调，而PilQ编码基因表达下调。尤为重要的是，具有多向转录后调控活性的Hfq编码基因发生突变并且表达增强，提示了耐药现象的转录后调控机制。此外，诱导后D株的生化代谢率也明显加快。基于上述研究数据，淋球菌对头孢曲松耐药是一个由降低药物亲和力、增加药物外排和减少药物进入细胞内等多种耐药机制共同参与的转录前和转录后调控现象共存的由量变到质变的复杂过程。