在细胞粘附与迁移中协调多种小GTP酶的Arap3的结构与功能研究
批准号:
31170693
项目类别:
面上项目
资助金额:
70.0 万元
负责人:
施蕴渝
依托单位:
学科分类:
结构生物学
结题年份:
2015
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
唐雅珺、王妹梅、鲍洪宇、汤衡、于海龙、吴勃
中文摘要
细胞粘附与迁移在正常生理过程中发挥作用,也与肿瘤细胞转移密切相关。多个小GTPase,在细胞黏附与迁移过程中起到重要的调控作用。小GTP酶在活化的GTP结合态和失活的GDP结合态之间循环,这两种过程受到鸟苷交换因子GEFs和 GTPase激活蛋白 GAPs的调控。Arap3是一个多结构域的蛋白,它是 Arf6以及RhoA 双功能的GAP。Arap3是协调细胞粘附与迁移过程中起着关键调控作用的4种小GTP酶(Rac1,RhoA,Arf6和Rap1)活性的桥梁之一。本课题以Arap3为研究对象,拟研究Arap3的磷酸化位点与VAV2相互作用的三维结构基础;研究Arap3分别作为Arf6GAP,作为RhoAGAP的三维结构基础,以及研究Arap3的ArfGAP活性和RhoAGAP活性如何受到蛋白质内部其它结构域以及外界因素包括:磷脂,钙离子,Rap1等的调控;研究Arap3受磷脂调节上膜的机制
英文摘要
Arap3是一个多结构域的蛋白,它是 Arf6以及RhoA 双功能的GAP。本课题以Arap3为研究对象,研究Arap3的磷酸化位点与VAV2相互作用的三维结构基础;研究Arap3分别作为Arf6GAP,RhoAGAP的三维结构基础,以及研究Arap3的ArfGAP活性和RhoAGAP活性如何受到蛋白质内部其它结构域以及外界因素的调控。.我们首次发现Arap3与Vav2的SH2结构域相互作用,它们之间的相互作用受到Arap3磷酸化水平的调节。我们解析了Vav2 SH2结构域本身的结构及它与小肽Arap3-pY1408的复合物结构,揭示了二者识别的结构基础。文章发表在Journal of Structural Biology 180 (2012) 84–95。.我们解析了Arap3的ArfAGAP及第二个PH结构域的三维结构,Arap3的ArfAGAP结构代表一种新的ArfGAP fold。发现第二个PH结构域对ArfAGAP活性有显著的调控作用。我们发现ArfGAP domain中GAP的关键活性位点残基Arg532十分重要。第二个PH结构域中的Arg445对于PH-ArfGAP的活性十分关键。我们做了PH2-ArfGAP的小角散射实验,正在构建PH2-ArfGAP的三维结构模型。企图说明PH2对-ArfGAP活性调节的机理。我们还证明钙离子不影响ArfGAP的活性。为了了解PH2结构域在活细胞中,在全长的基因中的作用,我们将全长的Arap3基因在PAE细胞中,包括野生型的和关键位点突变,说明在细胞中PH2结构域在Arap3调控Arf6活性中是关键的。此项工作目前正在成文,准备投稿。.我们分别获得了ARAP3_RhoGAP,以及Arap3 RhoGAP-RhoA.GDP AlF4-过渡态复合物的结构。这是第三个RhoGAP复合物的结构。复合物结构揭示了参与形成稳定复合物的RhoGAP上的关键带正电荷的残基与RhoA 的带负电荷的残基及GDP.AlF4−的形成稳定的复合物。我们将过渡态复合物的结构与其它RhoGAP-RhoA 复合物 的结构作了详细比较,发现复合物形成界面的显著差异。我们揭示Arap3 RhoGAP特异性调节RhoA 而非Cdc42, Rac1 活性的原因。此项工作目前正在成文,准备投稿。共发表有标注的SCI论文18篇。.
应激颗粒核心组分G3BP1,TTP对应激颗粒组装去组装的调控机制研究
-
批准号:31870760
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:65.0万元
-
批准年份:2018
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
睾丸特有的核小体变体及其调控因子的结构与动力学研究
-
批准号:31330018
-
项目类别:重点项目
-
资助金额:309.0万元
-
批准年份:2013
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
细胞黏性连接及紧密连接处Nectin-AF-6系统及claudin-ZOs系统蛋白质相互作用的三维结构基础
-
批准号:30830031
-
项目类别:重点项目
-
资助金额:185.0万元
-
批准年份:2008
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
人的BET家族蛋白质Brd2,Brd4与组蛋白识别专一性的三维结构基础
-
批准号:30670426
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:35.0万元
-
批准年份:2006
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
染色质结构改变相关蛋白质结构域三维结构与功能研究
-
批准号:30270293
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:22.0万元
-
批准年份:2002
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
用多维核磁共振波谱研究大鼠脑钠肽空间结构与功能
-
批准号:39470154
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:8.5万元
-
批准年份:1994
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
CI阻遏蛋白和操纵基因的特异性相互作用
-
批准号:38670007
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:3.0万元
-
批准年份:1986
-
负责人:施蕴渝
-
依托单位:
国内基金
海外基金