针对已有乳腺癌SELDI指纹图谱研究中筛选的两个血清候选蛋白质标志物BC1和BC2，进一步扩大乳腺癌患者血清库并继续随访。利用超滤膜、SCX/RP二维液相色谱、SDS-PAGE电泳及胶内酶切等方法分离、纯化；联合应用MALDI-TOF-TOF串联质谱、二维纳升液相色谱MDLC 结合LTQ Orbitrap串联高分辨质谱、傅立叶变换离子回旋共振质谱（FTICR）等手段解码候选标志物BC1和BC2。进一步制备相应的单克隆抗体并通过Luminex 100多功能液相芯片分析系统，实现血清样本的定量检测，并探索其与CEA、CA15.3等联合检测的价值。为乳腺癌的早期诊断、术后疗效评价、预后估计与随访、复发转移的监测提供帮助。同时建立快速、高效、准确的将差异表达蛋白质从复杂多肽谱中分离、纯化和解码的技术平台，提高解码蛋白质的成功率，以利于SELDI-TOF-MS应用研究的深入。