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组蛋白去甲基化酶JARID1B的PHD1结构域及其与组蛋白复合物的结构和功能研究

批准号:
31100526
项目类别:
青年科学基金项目
资助金额:
23.0 万元
负责人:
杨慧蓉
依托单位:
学科分类:
结构生物学
结题年份:
2014
批准年份:
2011
项目状态:
已结题
项目参与者:
杨莹、王平、郭雪

项目摘要

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项目成果

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中文摘要
JARID1B是2007年鉴定出来的一个新的组蛋白去甲基化酶,它能去组蛋白H3K4的一甲基、二甲基以及三甲基,在乳腺癌和前列腺癌的发生过程中起着重要的作用。JARID1B蛋白包括3个PHD(1个N端,两个C端)结构域。最近的研究表明PHD结构域能够识别组蛋白尾端的赖氨酸,发挥组蛋白密码解读器的功能,来调控基因的表达。一些去组蛋白甲基化酶的PHD结构域功能紊乱会导致包括癌症、免疫、神经紊乱以及血液系统疾病。本项目的目的是利用生化手段鉴定JARID1B的PHD1特异性识别何种组蛋白修饰,进而解析PHD1结构域以及与其识别的组蛋白的复合体结构,结合生化手段和细胞生物学的方法,来研究PHD1(本身存在与否,与组蛋白结合与否)对JARID1B酶活性的影响以及其识别组蛋白对乳腺癌、前列腺癌的调控机制。
英文摘要
本项目主要是研究JARID1B/KDM5B的第一个PHD1结构域的结构和功能,PHD结构域可以识别不同的组蛋白修饰,被认为是重要的组蛋白“reader",已有报导PHD功能的紊乱导致癌症、神经紊乱以及血液系统疾病。我们已经通过多肽Pull-down和ITC技术检测到KDM5B的PHD1与未修饰的组蛋白有结合作用,我们通过核磁共振技术(NMR)得到了PHD1与未修饰的组蛋白多肽底物的结构,对结构进行分析,发现PHD1的结构与已经报导的PHD结构域有些微不同,我们鉴定了与结合相关的几个关键氨基酸位点(D308,L325,D328,W351),通过多肽pull-down和ITC实验证明确认了结合位点。通过免疫荧光实验我们证明这些突变关键氨基酸影响JARID1B的细胞内去甲基化酶活性,我们还证明这些关键突变氨基酸位点对于KDM5B在细胞内调控靶基因的表达水平有影响。这些结果都表明KDM5B的PHD1结构域对其在体内的功能维持起着非常重要的作用。相关的结果已经发表在Protein Cell, Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun以及复旦学报(医学版)上。
期刊论文列表
专著列表
科研奖励列表
会议论文列表
专利列表
DOI: --
发表时间: 2014
期刊: Protein Cell
影响因子:
作者: [Guo, Xue, Rong, Naiyan, Song, Yujiao, Xu, Youwei, Lan, Wenxian, Zhang, Xu, Liu, Maili, Xu, Yanhui, Cao, Chunyang, ]
通讯作者:
Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a PHD domain of human JARID1B
人 JARID1B PHD 结构域的结晶和初步晶体学分析
DOI: 10.1107/s1744309111021981
发表时间: 2011-08-01
期刊: ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS
影响因子: 0.9
作者: [Guo, Xue, Xu, Youwei, Yang, Huirong]
通讯作者: Yang, Huirong
spanThe PHD1 finger of KDM5B recognizes/spanspan unmodified H3K4 during the demethylation/spanspan of histone H3K4me2/3 by KDM5B/spanbr /
KDM5B 的 PHD1 指在 KDM5B 对组蛋白 H3K4me2/3 去甲基化过程中识别未修饰的 H3K4
DOI: --
发表时间: 2014
期刊: Protein Cell
影响因子: --
作者: [Guo, Xue, Rong, Naiyan, Song, Yujiao, Xu, Youwei, Lan, Wenxian, Zhang, Xu, Liu, Maili, Xu, Yanhui, Cao, Chunyang]
通讯作者: Cao, Chunyang
DOI: --
发表时间: 2012
期刊: 复旦学报(医学版)
影响因子: --
作者: [郭雪, 刘意, 杨慧蓉, 徐彦辉]
通讯作者: 徐彦辉
人源RNA聚合酶I转录前起始复合体和延伸复合体的结构研究
  • 批准号:
    32171199
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    杨慧蓉
  • 依托单位:
染色质重塑复合体NuRD 组装方式以及活性发挥的分子机制研究
  • 批准号:
    21ZR1407900
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    0.0万元
  • 批准年份:
    2021
  • 负责人:
    杨慧蓉
  • 依托单位:
mTORC2复合体的结构和功能研究
  • 批准号:
    31770781
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    杨慧蓉
  • 依托单位:
国内基金
海外基金