转录因子剂量效应调控体细胞重编程的表观遗传机制研究

批准号:
31970681
项目类别:
面上项目
资助金额:
58.0 万元
负责人:
刘晶
依托单位:
学科分类:
细胞命运及重编程
结题年份:
2023
批准年份:
2019
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘晶
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中文摘要
诱导多能干细胞(IPSC)技术的发明表明转录因子在细胞重编程方面发挥关键作用,然而转录因子协同调控细胞命运的分子机理仍有待阐明。本项目前期建立了一套新型高效的诱导多能干细胞因子体系,并发现其中关键转录因子GLIS1,ESRRB在诱导多能干细胞过程中具有显著的剂量效应,该发现提示转录因子调控细胞命运的存在更加精细的模型。本项目拟结合时间序列ATAC-seq,ChIP-seq以及IP-MS等染色质和蛋白质研究技术,系统研究GLIS1和ESRRB在不同剂量条件下的表观遗传动态变化谱,基因表达谱和蛋白质互作谱,进而建立转录因子剂量效应通过表观遗传机器影响体细胞重编程的分子作用模型。该研究将从定量角度揭示转录因子影响细胞重编程的新机制。
英文摘要
The invention of induced pluripotent stem cell (IPSC) indicated that transcription factors play a key role in somatic cell reprogramming. However, the detailed molecular mechanisms remain to be elucidated. Previously, we formulated a new set of transcriptional factor cocktails, in which, GLIS1 and ESRRB had significant dose effect. Those result offer us an ideal model to investigate the mechanism of cell fate transition quantitatively. In this project, by utilizing the chromatin and protein machinery analysis technologies, such as ATAC-seq, ChIP-seq and IP-MS, we will investigate the dynamics of gene expression, epigenetic modification and protein-protein interaction responded to the dosage effect, and then find the correlations between them. Finally, we will set up a model by which the dose effect of transcription factors function through epigenetic machinery to modulate the somatic cell reprogramming. This study will reveal the new mechanisms by which transcription factors affect cellular reprogramming quantitatively.
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MYOCD is Required for Cardiomyocyte-like Cells Induction from Human Urine Cells and Fibroblasts Through Remodeling Chromatin
MYOCD 是通过重塑染色质从人尿细胞和成纤维细胞诱导心肌细胞样细胞所必需的
DOI:10.1007/s12015-022-10339-7
发表时间:2022-03
期刊:Stem Cell Reviews and Reports
影响因子:4.8
作者:Xiangyu Zhang;Lijun Chen;Xingnan Huang;Huan Chen;Baomei Cai;Yue Qin;Yating Chen;Sihua Ou;Xiaoxi Li;Zichao Wu;Ziyu Feng;Mengying Zeng;Wenjing Guo;Heying Li;Chunhua Zhou;Shengyong Yu;Mengjie Pan;Jing Liu;Kai Kang;Shangtao Cao;Duanqing Pei
通讯作者:Duanqing Pei
DOI:10.15252/embj.2022110928
发表时间:2022-10
期刊:The EMBO Journal
影响因子:--
作者:Yue Qin;Xingnan Huang;Zepo Cai;Baomei Cai;Jiangping He;Yuxiang Yao;Chunhua Zhou;J. Kuang;Yihang Yang;Huan Chen;Yating Chen;Sihua Ou;Lijun Chen;Fang Wu;Ning Guo;Yapei Yuan;Xiangyu Zhang;Wei Pang;Ziyu Feng;Shengyong Yu;Jing Liu;Shangtao Cao;D. Pei
通讯作者:Yue Qin;Xingnan Huang;Zepo Cai;Baomei Cai;Jiangping He;Yuxiang Yao;Chunhua Zhou;J. Kuang;Yihang Yang;Huan Chen;Yating Chen;Sihua Ou;Lijun Chen;Fang Wu;Ning Guo;Yapei Yuan;Xiangyu Zhang;Wei Pang;Ziyu Feng;Shengyong Yu;Jing Liu;Shangtao Cao;D. Pei
DOI:10.1038/s41467-022-30325-4
发表时间:2022-05-19
期刊:Nature communications
影响因子:16.6
作者:
通讯作者:
DOI:10.1016/j.compbiolchem.2020.107415
发表时间:2020-11
期刊:Computational biology and chemistry
影响因子:3.1
作者:Junyi Li;Wei Jiang;Henry Han;Jing Liu-;Bo Liu-;Yadong Wang
通讯作者:Junyi Li;Wei Jiang;Henry Han;Jing Liu-;Bo Liu-;Yadong Wang
DOI:10.1074/jbc.ra120.014598
发表时间:2021-01
期刊:The Journal of biological chemistry
影响因子:--
作者:Wu L;Zhao G;Xu S;Kuang J;Ming J;Wu G;Wang T;Wang B;Zhu P;Pei D;Liu J
通讯作者:Liu J
体细胞诱导原始生殖细胞体系建立和分子机制研究
- 批准号:32370791
- 项目类别:面上项目
- 资助金额:50万元
- 批准年份:2023
- 负责人:刘晶
- 依托单位:
细胞命运调控
- 批准号:--
- 项目类别:优秀青年科学基金项目
- 资助金额:120万元
- 批准年份:2020
- 负责人:刘晶
- 依托单位:
c-Jun拮抗剂介导的体细胞重编程研究
- 批准号:31401264
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:24.0万元
- 批准年份:2014
- 负责人:刘晶
- 依托单位:
国内基金
海外基金
