云南是亚洲栽培稻的多样化中心之一，蕴藏有丰富的稻种遗传资源。通过稻瘟病菌菌株接种鉴定、遗传及连锁分析，项目组从云南稻种云系2号中鉴定到一个高抗稻瘟病的新基因Pi42(t)，并已将该基因精细定位于水稻第1染色体长臂上约160 kb的区域。本研究将以日本晴及93-11的基因组序列为参考，采用基于长片段PCR扩增技术的电子图位克隆法，从云系2号中分离克隆具有自主知识产权的抗稻瘟病新基因Pi42(t)，通过水稻的遗传转化互补实验及不同品种等位基因间的序列比较分析，阐明该基因的结构及生物学功能。该基因的克隆将不仅能直接应用于水稻转基因育种来改良水稻品种的稻瘟病抗性问题，而且为进一步阐明水稻品种高抗稻瘟病的机理、抗病基因与稻瘟病菌无毒基因之间的互作机制以及抗病基因演化等方面的研究提供重要的研究素材。