本项目选用微卫星和RAPD分子标记技术对日本大耳白黑眼兔群体遗传结构及遗传稳定性进行分析，并与日本大耳白兔的遗传结构与遗传性能进行比较。通过比较两个品系兔子的微卫星DNA和RAPD引物扩增图谱，并应用遗传分析软件分别进行基因频率、基因型频率、基因多样性、基因杂合度和2个群体的遗传相似性等遗传分析。拟从兔的微卫星位点和RAPD位点中筛选出能应用于日本大耳白黑眼兔遗传分析的位点；初步确定2个群体的遗传概貌和基因资源多样性现状，了解日本大耳白黑眼兔的遗传分化，从而为下一步建立标准化的日本大耳白黑眼兔种质生产基地提供数据支撑；同时也为日本大耳白黑眼兔基因结构的动态控制和种质资源交流与控制提供理论依据；对了解日本大耳白黑眼兔的群体遗传概貌及选种、育种、性状控制、生产管理具有指导意义，而且将加速我国实验用日本大耳白黑眼兔的标准化建设，为全方位地将日本大耳白黑眼兔实验动物化奠定基础。