蛋白质折叠问题的全原子分子动力学模拟研究
批准号：
10504012
项目类别：
青年科学基金项目
资助金额：
24.0 万元
负责人：
张建
依托单位：
学科分类：
凝聚态物理新兴与交叉领域
结题年份：
2008
批准年份：
2005
项目状态：
已结题
项目参与者：
李文飞、秦猛、盛乐标、徐维新、苏煜、铁祚庥
项目摘要
结项摘要
项目成果
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中文摘要
针对若干典型的蛋白质体系，结合凝聚态统计物理中最新的构象空间采样方法和手段，利用全原子及简化模型的分子动力学模拟，研究蛋白质折叠动力学，研究自由能面的复杂性及来源等,加深对蛋白质折叠问题的认识。具体内容包括：利用REMD构象空间采样方法，结合全原子模拟，研究downhill蛋白的特殊折叠行为；探索改进相空间采样效率及自由能面表征手段的新方法，将全原子模拟研究推广到更大更复杂的蛋白质体系中；研究蛋白
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DOI：
10.1063/1.2943202
发表时间：
2008-06
期刊：
The Journal of chemical physics
影响因子：
--
作者：
[Ling-Zhi Wu;John Z. H. Zhang;M. Qin;Fen Liu;Wei Wang]
通讯作者：
Ling-Zhi Wu;John Z. H. Zhang;M. Qin;Fen Liu;Wei Wang
DOI：
10.1529/biophysj.105.063552
发表时间：
2006
期刊：
Biophysical journal
影响因子：
3.4
作者：
[M. Qin;Jian Zhang;Wei Wang]
通讯作者：
M. Qin;Jian Zhang;Wei Wang
DOI：
10.1021/jp076213t
发表时间：
2007-12-13
期刊：
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B
影响因子：
3.3
作者：
[Li, Wenfei, Zhang, Jian, Wang, Wei]
通讯作者：
Wang, Wei
Metal-coupled folding of Cys2His2 zinc-finger
Cys2His2 锌指的金属耦合折叠
Cys2His2 锌指的金属耦合折叠
DOI：
10.1021/ja075302g
发表时间：
2008-01-23
期刊：
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
影响因子：
15
作者：
[Li, Wenfei, Zhang, Jian, Wang, Wei]
通讯作者：
Wang, Wei
Folding mechanism of Trpzip2 ?-hairpin studied by all-atom REMD simulations
全原子REMD模拟研究Trpzip2 α-发夹的折叠机制
全原子REMD模拟研究Trpzip2 α-发夹的折叠机制
DOI：
--
发表时间：
--
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
共 8 条
基于机器学习的RNA结构预测
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批准号：11774158
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项目类别：面上项目
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资助金额：65.0万元
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批准年份：2017
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负责人：张建
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依托单位：
RNA结构预测与折叠热力学动力学研究
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批准号：11274157
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项目类别：面上项目
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资助金额：78.0万元
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批准年份：2012
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负责人：张建
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依托单位：
非编码RNA三级结构预测及其折叠动力学研究
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批准号：10974088
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项目类别：面上项目
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资助金额：34.0万元
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批准年份：2009
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负责人：张建
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依托单位：
国内基金
海外基金