面向多组学癌症数据的多视图生存分析算法的研究
批准号:
62106136
项目类别:
青年科学基金项目(C类)
资助金额:
30.0 万元
负责人:
刘诚
依托单位:
学科分类:
模式识别与数据挖掘
结题年份:
2024
批准年份:
2021
项目状态:
已结题
项目参与者:
刘诚
中文摘要
癌症是威胁人类生命健康的重要因素,探索癌症的产生和发展机制有利于对癌症进行有效的治疗。生存分析算法可以有效地探索癌症患者的生存时间与各种不同影响因素之间的内在关系,进而为癌症的研究提供更有价值的参考信息。同时,多组学数据从不同的视角描述了疾病的不同特性,也为癌症的研究和相关算法的建模提供了更加全面的数据支持。基于此,本项目将面向多组学癌症数据,结合多视图学习算法机制,提出多视图生存分析算法框架。通过兼容不同组学数据之间的各自优势和规避各自局限、探索癌症亚型和挖掘生物标志物等内容的研究,解决多组学癌症数据所关联的关键科学问题,为癌症的临床研究建立更加准确的生存分析模型并有效地挖掘生存时间与各种因素之间的内在联系,从而实现能够为更加深刻地认识疾病提供有效的算法支持的研究目标。
英文摘要
Cancer has a significant impact on public health. Discovering the progression of disease is beneficial to provide more precise treatment for patients. Survival analysis is an effective way to exploit the underlying relationship between survival time and clinical features and thus is helpful to the understanding of disease progression. In addition, advances of high throughput experimental methods have led to the availability of more diverse omic datasets in clinical analysis application. It is important for clinical analysis to exploit different types of omic data simultaneously. Toward this end, this proposal aims to propose a multi-view survival analysis algorithm framework for multi-omic cancer data application by exploring consistent and complementary information among multi-omic data, identifying meaningful cancer subtypes and biomarker information. As a result, the proposed multi-view survival analysis framework is able to identify biologically meaningful information for clinical research.
本项目聚焦于多组学癌症数据分析,旨在通过多视图学习和生存分析算法,从复杂数据中提取有价值信息,提升癌症亚型分类和生存预测的准确性。研究提出了一系列创新算法框架,包括多组学癌症亚型识别与生存分析的协同学习算法、自监督图补全多视图聚类算法、自引导部分图传播算法等,有效解决了数据缺失、异构性和复杂性问题。此外,项目还拓展至单细胞测序数据分析,提出了基于多尺度基因子向量补全的Transformer模型等方法,显著提升了细胞类型识别的准确性和鲁棒性。.项目开展至结题期间,共发表15篇高水平学术论文,其中9篇被SCI收录,7篇发表于EI学术会议;申请2项发明专利;培养4名研究生,其中3名在相关领域发表了重要学术论文。研究成果在多个公开癌症组学数据集上得到验证,推动了多视图学习算法在生物医学领域的应用发展,丰富多视图学习和机器学习领域的算法内容。
基于图分布对齐的多视图学习算法研究
及其在不完备多组学癌症数据分析中的
应用
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:刘诚
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依托单位:
自适应多任务学习算法研究及其在癌症数据分析中的应用
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2022
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负责人:刘诚
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依托单位:
国内基金
海外基金