转运RNA衍生片段在子宫内膜癌中的作用机制与临床意义
批准号:
82072857
项目类别:
面上项目
资助金额:
55.0 万元
负责人:
陆燕
依托单位:
学科分类:
肿瘤诊断
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
陆燕
中文摘要
tRFs是一类新型的转运RNA衍生的小RNA片段。近年来针对tRFs的功能解析迅猛发展,但其具体作用方式和参与的信号通路仍知之甚少。我们前期研究发现,在子宫内膜癌肿瘤组织存在大量异常表达tRFs,来源于血浆外泌体的若干5ʹ-tRFs可以准确区分健康人和子宫内膜癌病人,并初步鉴定了子宫内膜癌中的tRF ArgTCT-20在肿瘤中异常高表达且与病人预后显著负相关。为此,我们提出了tRFs失调促进了子宫内膜癌发生发展进程的研究假说。本项目将利用小RNA测序数据鉴定子宫内膜癌的驱动tRFs,建立能有效地早期诊断并预测早期子宫内膜癌病人临床结果的tRF表达谱,阐明tRFs在子宫内膜癌发生发展和转移复发中的作用及机制。本项目有望发现作为癌症药物新靶点的tRFs及其调控的下游因子。同时,预期发现的tRFs有潜力作为临床诊断和预后的分子标记物,从而为将来子宫内膜癌病人个性化治疗打下坚实基础。
英文摘要
Transfer RNA-derived RNA fragments (tRFs), a novel class of small non-coding RNAs, have received much attention in the past few years, yet their mechanistic role in cancer remains largely unexplored. Our preliminary data analysis has revealed that both 5ʹ-tRFs and 3ʹ-tRFs were globally dysregulated in endometrial tumor tissues. We also performed small RNA sequencing in 29 plasma samples from healthy volunteers and endometrial carcinoma patients, and identified several candidate exosomal tRFs as diagnosis biomarkers for non-invasive screening endometrial carcinoma patients. We further identified a candidate cancer driver tRF ArgTCT-20 which was highly expressed in endometrial carcinoma and was significantly associated with worse prognosis of endometrial carcinoma patients. Based on our strong and extensive preliminary data, we hypothesized that dysregulations of tRFs promote tumorigenesis and progression in the endometrium. To test our hypothesis, we proposed to develop an innovative bioinformatics tool to identify cancer driver tRFs, identify a tRF signature which can distinguish tumor patients from health women and tumor precursors, and investigate their mechanistic roles in endometrial tumorigenesis and progression. At the successful completion of this project, we will identify tRF-regulated downstream elements and determine their mechanistic roles in endometrial cancer. Such results are highly likely to provide novel biomarkers for diagnosis and prognosis and anti-cancer therapy in addition to fundamentally advancing the knowledge of endometrial tumorigenesis and progression.
tRFs是一类新型的转运RNA衍生的小RNA片段。近年来针对tRFs的功能解析迅猛发展,但其具体作用方式和参与的信号通路仍知之甚少。本项目利用自主研发的TCGA泛癌分析平台,系统分析了TCGA 数据库中12种肿瘤类型中的tRFs表达谱,发现了11个tRFs 在大多数肿瘤中显著上调,且与预后不良高度相关。其中一个来源于tRNA-Ala-AGC-1-1 3’-末端的长度为18个碱基的3’-tRF——“癌症相关候选 tRF1(cancer associated tRF 1,CAT1)”——被发现在多种肿瘤组织中的表达均上调,并且其高表达与多种类型癌症患者的不良生存预后呈正相关。Db-PCR显示子宫内膜癌和肺癌患者血浆中CAT1的表达明显高于健康对照,CAT1有潜力作为临床诊断和预后的分子标记物。细胞学实验证实CAT1在子宫内膜癌和肺癌中作为促癌驱动因子发挥作用。RNA pull-down实验、质谱分析结合Western blot和RNA免疫共沉淀(RIP)实验证实CAT1与RBPMS蛋白之间可以相互结合,并且这种相互作用很可能依赖于RBPMS中的RNA识别基序(RRM)对CAT1序列中的含有CAC RNA识别元件(RRE)的识别。 RBPMS-RIP-seq结合qPCR以及RBPMS-RIP-qPCR证实CAT1和RBPMS可以通过相互作用调节NOTCH2等mRNA的表达。进一步研究表明CAT1与RBPMS结合抑制CCR4-NOT脱腺苷复合体介导的NOTCH2 mRNA的降解, 从而上调NOTCH2表达促进肿瘤发生发展。生物信息学分析发现CAT1和miR-2355-5p具有相同的种子序列,细胞学实验证实两者竞争性结合靶基因HRK以保护其免受降解、促进其表达,通过HRK/p21轴在在子宫内膜癌中发挥抗凋亡作用。
恶性肿瘤精准诊治新技术和新策略研究-基于单细胞多组学、蛋白组学和影像组学的卵巢癌耐药、转移和复发风险预测的多模态机器学习模型及可能治疗方式
-
批准号:2025C02053
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:0.0万元
-
批准年份:2025
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
转移抑制蛋⽩MTSS1调控肿瘤微环境来促进卵巢癌转移的作⽤及机制研究
-
批准号:82372870
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:49万元
-
批准年份:2023
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
长三角城市群人为热释放对区域大气污染物浓度的影响机制研究
-
批准号:LQ21D050002
-
项目类别:省市级项目
-
资助金额:0.0万元
-
批准年份:2020
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
基于NGS的大规模挖掘早期卵巢癌预后的环状RNA分子标志物
-
批准号:81772766
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:55.0万元
-
批准年份:2017
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
癌症基因组测序分析鉴定驱动基因及其路径的方法研究
-
批准号:31401125
-
项目类别:青年科学基金项目
-
资助金额:25.0万元
-
批准年份:2014
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
CREBBP突变预测卵巢癌复发及其个性化治疗方案
-
批准号:81472420
-
项目类别:面上项目
-
资助金额:72.0万元
-
批准年份:2014
-
负责人:陆燕
-
依托单位:
国内基金
海外基金