微单倍型测序在混合检材亲缘关系分析中的应用研究
批准号:
82072119
项目类别:
面上项目
资助金额:
56.0 万元
负责人:
欧雪玲
依托单位:
学科分类:
法医物证学及法医人类学
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
欧雪玲
中文摘要
目前,法医实践中常规的混合斑检验主要通过分析和检测检材的DNA遗传标记并与嫌疑人进行比对,或在法医DNA数据库中进行检索,以达到个人识别的目的。随着社会多元化发展和鉴定案情的复杂化,涉及亲缘关系鉴定分析的混合斑检验发挥着越来越重要的作用。现有基于PCR-CE技术的STR分型在解决这一难题时依然困难重重,经常不能获得明确的鉴定结果。本项目拟基于下一代测序技术的最新进展,筛选和构建一个高信息量微单倍型遗传标记的复合检测体系,为混合检材分析提供高效能的检测手段。同时,以三种常见亲缘关系为代表,应用贝叶斯网络等多种概率模型,对不同检验假设、不同类型的混合检材亲缘关系分析所获得的大信息量检测数据进行评估。基于实际检测数据和计算机模拟数据,结合等位基因丢失、插入、突变等因素,逐步建立和优化一个从混合检材微单倍型分型到亲缘关系证据评估的可执行策略,以满足公共安全领域日益复杂的鉴定需要。
英文摘要
Nowadays, the routine examination of DNA mixtures collected in forensic crime scene provide the essential clues for the investigation mainly by comparing the STR results of the mixture with the suspect, or searching in the forensic DNA database. With the development of social diversity and the increasing complexity in forensic practice, kinship analysis plays an increasingly important role in forensic practice. In this situation, the existing STR typing approach based on PCR-CE platform is still difficult to solve this problem and often fail to draw a clear conclusion. Based on the latest development of next generation sequencing technology, this study aims to screen and construct a multiplexing microhaplotype-based detecting system, which is expected to provide high detecting efficiency for DNA mixture analysis. At the same time, based on three kinds of common relationship, the Bayesian network and other probability models are used to analysis the microhaplotype sequencing data of mixture with different mixing proportion and condributors, and evaluate the weight of evidence under different testing assumptions, combining multiple essential factors, such as allele dropout, drop-in, mutation, et al. This study is expected to establish an optimized strategy for the relationship inference involving forensic DNA mixtures.
为解决利用法医混合检材进行亲缘关系精确鉴定这一技术难题,本项目基于高通量测序平台,优选基因组内适用于混合检材亲缘关系分析的高信息量微单倍型遗传标记,基于不同供体数目、混合比例、混合层次的疑难混合DNA检材开展了法医遗传学的研究探索,达到了以下研究目标:.1)复合检测体系的构建:成功构建了灵敏度达到1ng、检测长度控制在150bp、基于高通量测序平台的185个微单倍型位点的复合检测体系;以不同供体数目、混合比例、混合层次的疑难混合DNA检材作为研究对象,成功完成检测并获得高质量的微单倍型测序数据;.2)数据分析策略的制定:以三种常见的亲缘关系为代表,其中包括父(母)子、全同胞、以及同属于二级亲属的祖孙、叔侄、半同胞等,应用贝叶斯网络等概率模型成功建立了基于混合DNA进行各级亲缘关系鉴定的数据分析策略;并对多个混合斑的联合分析(包括两个混合斑之间是否存在共有供者和是否有亲缘关系的分析);.3)鉴定效力的评估:基于大规模模拟数据和真实混合DNA数据,从特异性、灵敏性、准确性等几方面系统评估所构建的检测体系和分析策略在不同检验假设下对不同组分混合比例检材进行亲缘关系评估的鉴定效力,为解决基于疑难混合DNA进行复杂亲缘关系的技术难题提供定量的、准确的解决方案。
微单倍型高通量测序在混合样本亲缘关系分析中的应用探索
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批准号:--
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2021
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负责人:欧雪玲
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依托单位:
基于微单倍型高通量测序的游离胎儿DNA法医遗传学应用研究
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批准号:2020A1515010775
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2020
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负责人:欧雪玲
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依托单位:
母血浆胎儿DNA甲基化标记的法医学应用基础研究
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批准号:81471825
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项目类别:面上项目
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资助金额:72.0万元
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批准年份:2014
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负责人:欧雪玲
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依托单位:
母体循环中胎儿表观遗传学信息靶标的筛选与检测
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批准号:81001352
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2010
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负责人:欧雪玲
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依托单位:
国内基金
海外基金