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染色体2q33.1区域遗传变异调控CASP8基因表达影响肺癌易感性的分子流行病学研究

批准号:
82103926
项目类别:
青年科学基金项目(C类)
资助金额:
30.0 万元
负责人:
秦娜
依托单位:
学科分类:
非传染病流行病学
结题年份:
2024
批准年份:
2021
项目状态:
已结题
项目参与者:
秦娜

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
全基因组关联研究已鉴定出一系列肺癌的遗传易感变异,然而这些变异的生物学功能尚不明确。本项目前期的研究鉴定出六个新的肺癌易感区域,并基于功能基因组学数据对易感变异进行注释和功能评价,发现染色体2q33.1区域的CASP8基因受三个遗传变异(编码和非编码区)调控,然而这些变异调控CASP8表达的机制以及在肺癌发生中的功能都有待进一步探索。因此,本项目拟首先通过生物信息学分析和分子生物学实验明确2q33.1区域的致病变异,阐明其影响CASP8转录的机制;随后基于分子生物学实验探讨CASP8致病变异影响肺癌发生的生物学功能;最后基于巢式病例-对照研究,评估致病变异对血浆CASP8表达的影响以及CASP8与肺癌发生风险的关联。本项目的实施有助于阐明肺癌易感区域2q33.1的遗传易感机制,为揭示肺癌遗传病因提供新证据。此外,本研究发现的致病基因将有可能成为肺癌筛查的生物标志物,具有潜在公共卫生学意义。
英文摘要
Genome-wide association studies (GWAS) have implicated a large number of susceptibility variants for lung cancer; however, elucidating the underlying mechanisms of these variants during lung carcinogenesis remains challenging. Recently, we conducted a large-scale GWAS of lung cancer and identified six novel susceptibility loci. Then, we systematically evaluated the function of lung cancer susceptibility variants by integrating bioinformatics algorithms and functional genomics data. The preliminary result implicated that three functional variants at 2q33.1 could regulate the expression of CASP8 through affecting the protein coding function and the activity of promoter and enhancer elements. Nevertheless, the effects of these variants and CASP8 on the development of lung cancer remain to be explored. Thus, in this project, firstly, we intend to explore the biological mechanisms of genetic variants regulating expression of CASP8 underlying lung carcinogenesis by integrating bioinformatics analysis and functional experiment methods; secondly, we will explore the role of CASP8 in regulating ligand-induced apoptosis of tumor cells and the mechanism of CASP8 in the development of lung cancer at both the molecular and cellular levels; finally, we will evaluate the association between serum CASP8 and lung cancer risk based on a nested case-control study. In summary, the implementation of this project will help to unravel the effects of CASP8 and causal variants at 2q33.1 on the development of lung cancer. In addition, this project has important public health significance as it provides a new perspective for using susceptibility genes as biomarkers for risk stratification of lung cancer.
全基因组关联研究已鉴定出一系列肺癌的遗传易感变异。其中,染色体2q33.1区域是申请人所在团队前期新识别的中国人群肺癌易感区域,但是该区域的致病变异及其影响肺癌发生的生物学功能尚不明确。为了揭示该区域的致病变异和基因,并阐明其影响肺癌发生的生物学功能,本项目开展系列研究。首先,本项目综合利用多种生物信息学预测方法、功能基因组数据、报告基因实验和体内外表型实验,鉴定CASP8基因第一外显子区域的错义变异rs3769823(K14R)为潜在致病变异,可通过改变CASP8的蛋白编码能力增加caspase-8和cleaved caspase-8的表达水平,抑制肺癌细胞的增殖和侵袭;随后,通过流式分析阐明了rs3769823(K14R)影响TRAIL介导的细胞凋亡通路并抑制肺癌发生的分子机制;此外,结合19546例中国人群基因组数据,本项目揭示了CASP8相关基因区域的嵌合拷贝数改变可作为肺癌发生风险的标志物,并在45万人的前瞻性队列中评估了其与遗传风险评分联用可优化肺癌高危人群评估的效能;最后,基于巢式病例对照研究设计,本项目探讨了血浆CASP8表达作为肺癌早期筛查分子标志物的潜能。综上,本项目系统阐明染色体2q33.1区域致病变异影响肺癌发生的潜在生物学机制,为揭示肿瘤的遗传病因提供了新的研究范式,并补充和完善现有的肺癌遗传病因理论,为提高肺癌早期风险预测能力和促进肺癌的精准防治提供新思路。
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