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开发变构调节方法学针对几类重要疾病靶标的理论研究和应用

批准号:
22077082
项目类别:
面上项目
资助金额:
63.0 万元
负责人:
陆绍永
依托单位:
学科分类:
化学生物学理论、方法与技术
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
陆绍永

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
变构药物作为一种全新的药物作用模式,具有靶标选择性强和药物副作用低的优势。但是对于难靶靶标,目前变构药物设计还缺乏有效的方法针对这类靶标进行变构药物开发。而且,当前变构药物方法学普遍存在变构位点识别成功率低的事实,以及缺乏合理的方法研究变构药物对靶标的调控机制和变构药物作用机理。基于上述难点,在本项目中,申请人在前期对难靶K-Ras4B肿瘤蛋白和组蛋白去乙酰化酶SIRT6的研究基础上,开发隐式变构位点方法学,识别临床热点突变体K-Ras4BG12D和K-Ras4BG12V的隐式变构位点,为设计变构药物靶向难靶K-Ras4B突变体奠定基础。开发普适性的反向变构调节方法,识别SIRT6蛋白新的变构位点。阐明变构小分子对SIRT6的变构调节机制以及变构药物作用机理。这些开发的分子靶向变构药物设计的理论和方法,不仅加深对生物大分子变构调节理论的理解,也为从事创新药物研发的科研人员提供更有效的工具。
英文摘要
As a novel mode of drug interaction, allosteric drugs have the advantages of promising target selectivity and lower side effects. However, for some especially important yet difficult targets, there is a lack of effective methods tailored for the development of allosteric drugs. In addition, the current allosteric drug methodology faces the common challenge of low success rate in allosteric site recognition, as well as the lack of reasonable methods to study the regulatory mechanism of allosteric drugs. To tackle these difficulties, based on previous research about K-Ras4B oncoprotein, we will develop an allosteric method to identify hidden allosteric sites of the clinical hot mutants K-Ras4B G12D and K-Ras4B G12V, laying a foundation for targeting the difficult K-Ras4B mutants by allosteric modulators. Moreover, based on previous research about histone deacetylase SIRT6, we will develop a general method of reversing allosteric regulation to identify new allosteric sites on SIRT6, illustrate the allosteric regulatory mechanisms of small molecules targeting SIRT6, and reveal the pharmaceutic action mechanisms of allosteric drugs. These developed methods for molecule-targeted allosteric drug design, not only deepen the understanding of biomacromolecule allosteric regulation, but also provide more effective tools for the researchers engaged in innovative drug development.
作为一种全新的药物作用模式,变构药物具有靶标选择性强和药物副作用低的特点。但是,对于难靶靶标,目前变构药物设计还缺乏有效的方法针对这类靶标进行变构药物开发。而且,当前变构药物方法学普遍存在变构位点识别成功率低的事实,以及缺乏合理的方法研究变构药物对靶标的调控机制和变构药物作用机理。. 项目负责人通过计算生物学、生物信息学、药物设计和药物化学、化学生物学等方法,开发了基于分子力场和轻推弹性带方法(Nudged elastic band)的增强采样方法,识别A类G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor, GPCR)-血管紧张素受体(AT1R)的隐式变构位点和阐明C类GPCR代谢性谷氨酸受体5型(mGlu5)二聚体变构活化的全景构象空间及机制;开发反向变构调节方法AlloReverse,识别SIRT6蛋白新的隐式变构位点Pocket Z, 并基于此发现高选择的小分子变构抑制剂JYQ-42;利用长时间分子动力学模拟结合酶动力学实验,揭示小分子变构激动剂MDL-801的5-Br原子作为变构驱动子,控制变构分子的效能。阐明变构调节分子MDL-801对SIRT6的变构激活机制,为基于变构机制的药物研发奠定基础。这些研究不仅可以加深对生物大分子变构调节理论的理解,也为重要疾病靶标原创药物开发提供新的可行方案。. 从2021年起,项目负责人发表与本项目直接相关且标注本基金资助的论文14篇,第一作者论文1篇,最后通讯作者7篇,共同通讯作者6篇。其中,影响因子超过10分6篇,代表性论文包括发表于国际重要学术期刊如:Nature Communications、Chemical Science、Nucleic Acids Research、Acta Pharmaceutica Sinica B、Signal Transduction and Targeted Therapy等。
PI3Kα/钙调蛋白协调调控K-Ras4B在胰腺导管腺癌中的分子机制及靶点识别
  • 批准号:
    21778037
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    陆绍永
  • 依托单位:
新型SENP1抑制剂的设计、合成及抗前列腺癌活性的研究
  • 批准号:
    81302698
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万元
  • 批准年份:
    2013
  • 负责人:
    陆绍永
  • 依托单位:
国内基金
海外基金