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基于单细胞质谱流式技术研究肌层浸润性膀胱癌分子亚型异质性以及KLF14介导的Ba/Sq亚型免疫抑制微环境形成机制

批准号:
82060460
项目类别:
地区科学基金项目
资助金额:
34.0 万元
负责人:
李天宇
依托单位:
学科分类:
肿瘤免疫治疗
结题年份:
2024
批准年份:
2020
项目状态:
已结题
项目参与者:
李天宇

项目摘要

结项摘要

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中文摘要
肌层浸润性膀胱癌(MIBC)是一组具有不同临床病程、不同治疗反应且机制尚未明确的分子异质性肿瘤。基于不同基因表达模式的分子分型策略对于阐明MIBC的机制提供了新的框架。本项目前期采用最新的共识性分子分型法分型鉴定MIBC,利用质谱流式技术从单细胞层面初步阐明六种亚型肿瘤干细胞类亚群和免疫细胞亚群异质性特征,其特征细胞亚群可能与患者的预后相关。进一步研究发现Ba/Sq亚型是免疫抑制程度最高的亚型,其机制可能与转录因子KLF14对调节性T细胞的功能调控有关。本项目拟采用质谱流式、镜像质谱流式和全转录组测序技术,多维度精准分析MIBC各亚型肿瘤干细胞类亚群和免疫细胞亚群,找出与临床预后相关的特征细胞亚群,阐明其基因表达特征,并结合CRISPR/Cas9基因编辑技术研究KLF14对Ba/Sq亚型免疫抑制微环境形成的作用和机制,本研究有助于开发新的个性化治疗方案以改善MIBC患者的生存质量。
英文摘要
Muscle invasive bladder cancer (MIBC) is a group of molecular heterogeneous tumors with different clinical course, different treatment responses, and the mechanism is not yet clear. Molecular classification strategies based on different gene expression patterns provide a new framework for elucidating the mechanism of MIBC. In the previous stage of this project, MIBC were identified by the latest consensus molecular classification strategy. The heterogeneity characteristics of tumor stem-like cell subsets and immune cell subsets of six subtypes were preliminarily elucidated from the single cell level by mass cytometry, and their characteristic cell subsets may be related to the prognosis of patients. Further study found that Ba/Sq subtype is the most immunosuppressive subtype, and its mechanism may be related to the regulation of regulatory T cell function by transcription factor KLF14. The purpose of this project is to use mass cytometry, imaging mass cytometry and RNA-seq techniques to accurately analyze tumor stem-like cell subsets and immune cell subsets of MIBC subtypes from multi-dimensional, to identify characteristic cell subsets related to clinical prognosis and clarify their gene expression characteristics, then to combine CRISPR/Cas9 gene editing technology to study the effect and mechanism of KLF14 on the formation of immunosuppressive microenvironment of Ba/Sq subtypes. This study is helpful to develop personalized treatment schemes to improve the quality of life of patients with MIBC.
肌层浸润性膀胱癌(MIBC)是一组分子异质性疾病,易复发转移,预后差。复杂的肿瘤微环境是肌层浸润性膀胱癌高异质性和治疗反应差的一大诱因。共识性的MIBC六分型法为MIBC异质性研究提供了新思路。我们应用质谱流式技术在单细胞水平揭示了MIBC免疫细胞和肿瘤细胞的多样性表型,发现具有强免疫抑制表型的T细胞亚群在Ba/Sq亚型中富集,与MIBC不良预后密切相关的癌症干细胞样细胞亚群(ALDH+PD-L1+ER-β-)在NE-like亚型中富集,它们可能是诱导Ba/Sq亚型免疫抑制微环境和NE-like亚型不良预后的关键因素。机制分析发现,癌症干细胞样细胞亚群(ALDH+PD-L1+ER-β-)可能受到B4GALNT1的调控。通过镜像质谱流式技术的空间重构,我们探究了MIBC肿瘤微环境的时空异质性,在组织原位水平揭示了MIBC不同的胶原形态、血管形态和免疫细胞分布模式。进一步的生物信息学分析发现,特征成纤维细胞亚群S3(α-SMA+ Collagen I+ Vimentin+ CD90+)倾向于在Ba/Sq亚型和 NE-like亚型中富集,其与MIBC的不良预后密切相关。结合单细胞测序和空间转录组测序分析发现,成纤维细胞亚群S3可能通过受配体对NOTCH1-JAG2与内皮细胞相互作用,促进异常肿瘤血管新生,其机制与YAP调控有关。综上所述,本研究在单细胞水平和空间水平,较为系统地探究了MIBC微环境中免疫细胞、肿瘤细胞、胶原和血管的多样性表型和时空异质性,发现了与临床不良预后密切相关的特征细胞亚群,并揭示了其潜在的作用机制。本研究为MIBC肿瘤微环境异质性研究提供了多维度的信息,为MIBC个性化治疗方案的开发提供了潜在靶点。
SUMO化修饰影响膀胱癌的发生发展和化疗敏感性的研究
  • 批准号:
    81760454
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    36.0万元
  • 批准年份:
    2017
  • 负责人:
    李天宇
  • 依托单位:
国内基金
海外基金