课题通过大规模的基线调查，共调查体检居民62298人，其中HBsAg阳性者3403人，HBsAg阳性率为5.46%；HBsAg和抗HBs同时阳性感染者99人，在HBsAg阳性人群中所占比例为2.91%。通过调查问卷,收集感染者流行病学资料，分析得到HBsAg和抗HBs双阳性感染者流行病学特征，发现HBsAg和抗HBs双阳性人群中，HBeAg阳性感染者显著多于HBsAg单独阳性感染者（0.303 vs 0.104， P＜0.05）。在基线调查的基础上，进行了HBsAg和抗HBs双阳性感染者病毒分子生物学特征分析，对其基因型、血清型分布，特别是病毒S区基因变异特征以及准种特征进行研究。发现双阳性感染者病毒S区基因序列的突变率高于单阳性者，HBsAg和抗HBs双阳性感染者每100个氨基酸的突变个数为2.42个，而对照组每100个氨基酸的突变个数为1.33个，两者有显著性差异（P＜0.05）。HBsAg和抗HBs双阳性感染者“a”决定族（aa124-147）、CTL细胞识别表位（aa41-49）、（aa87-95）、（aa207-216）和（aa215-223）内氨基酸突变率显著高于对照组。准种分析结果则显示HBsAg和抗HBs双阳性感染者病毒S区基因序列中有更多的阳性选择位点，且大多位于乙肝病毒的免疫表位区，而HBsAg和抗HBs双阳性感染者病毒S区基因的氨基酸复杂度、平均遗传距离、平均同义替换数和平均非同义替换数均小于对照组，其中平均遗传距离和同义替换数较对照组均有显著性差异。另外，课题对基线调查中筛检的HBsAg阳性人群及HBsAg和抗HBs双阳性感染者进行了随访，比较血清学特征发生变化的感染者相应的流行病学特征，目前未发现各组间有显著差异。对外周血中共同存在的HBsAg和抗HBs的免疫学特性检测结果显示，双阳性研究组和对照组外周血纯化的IgG对HBsAg的结合力没有差别。本研究通过建立的研究队列，结合临床和流行病学现场调查资料，探讨HBsAg和抗HBs共同存在现象的分子机制和流行病学意义，为乙型肝炎的防控提供了理论和实践依据。