在上一个国家自然科学基金资助下，我们在嗜盐古菌中发现了在三域生物中（细菌域、真核生物域和古菌域）均有启动子功能的DNA片段，这是首次在启动子结构和功能上证实古菌的三域融合特征，但这些启动子DNA为什么能在不同进化地位的生物中行使同样的功能？它们在起始转录上（包括TBP、TFB和RNA聚合酶的结合位点，转录起始位点等）有什么差异？在三域生物中是否存在一种新的转录起始模式？等问题值得进一步探索。本申请项目拟通过对代表性的三域启动子（RM07、RMl0和RMl4）的野生型、各种缺失和点突变在三域生物中的转录和启动报告基因的表达水平的研究，并对比在无细胞转录系统中转录起始复合物形成的差异来进一步揭示古菌在转录中某些未被认识的生命特征，为在转录水平上对争论中的生命系统发育树、发现新型启动子和构建通用表达载体提供有价值的信息、观点和途径。