Complete mitochondrail genome of Corydoras panda (Teleostei, Siluriformes, Callichthyidae, Corydoradinae).
Complete mitochondrail genome of Corydoras panda (Teleostei, Siluriformes, Callichthyidae, Corydoradinae).
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DOI：
10.1080/23802359.2019.1660253
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发表时间：
2019-09-03
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xu B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu Q;Liu Y;Xiao T;Xu B
在这项研究中，我们报道了熊猫 Corydoras 下一代测序产生的完整线粒体基因组。线粒体基因组总长度为16,611bp，碱基组成分别为32.50%A、26.30%T、26.10%C和15.10%G。它包含两个核糖体RNA基因、13个蛋白质编码基因、22个转移RNA基因和一个主要非编码控制区（D环区）。这些基因的排列与鲶形目中发现的相同。利用邻接法对熊猫和鲶形目其他 18 个物种的完整线粒体基因组进行系统发育分析。拓扑结构表明，属于九个属的所有物种都分为三个类群（鲶科、鳅科和Callichthyidae），并且熊猫与Corydoras属的其他物种聚集在一起。熊猫Corydoras外部形态特征分类与分子分类结果一致，因此线粒体基因组信息可用于今后Corydoras物种的鉴定。
We reported the complete mitochondrial genome yielded by next-generation sequencing of Corydoras panda in this study. The total length of the mitochondrial genome is 16,611 bp, with the base composition of 32.50% A, 26.30% T, 26.10% C, and 15.10% G, respectively. It contains two ribosomal RNA genes, 13 protein-coding genes, 22 transfer RNA genes, and a major non-coding control region (D-loop region). The arrangement of these genes is the same as that found in the Siluriformes. The complete mitogenomes of C. panda and other 18 species from Siluriformes were used for phylogenetic analysis using Neighbor-Joining method. The topology demonstrated that all species belong to nine genera are divided into three groups (Siluridae, Loricariidae, and Callichthyidae), and the C. panda was clustered with other species from genus Corydoras. Corydoras panda external morphological feature classification is consistent with the molecular classification results, so the information of the mitogenome could be used for future identification of Corydoras species.
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